r - 检测社区导致孤立节点

Question

我正在尝试从我的图表中收集一些社区。然而，由此产生的社区由孤立的节点组成，这与我对社区的理解相矛盾。这是我必不可少的 R/igraph 代码：

g<-simplify(g)
print("isolates: ")
length(which(degree(g)==0)-1) # says 0

c<-fastgreedy.community(g)

cmem<-community.to.membership(g,c$merges,3081)
w<-which(cmem$membership==0)  
sub<-subgraph(g,w)

print("isolates in subgraph: ")
length(which(degree(sub)==0)-1) # says > 0

我犯错了吗？谢谢您的帮助。

Answer 1

您忘记从 中减去 1 which(cmem$membership == 0)，这是必需的，因为 igraph 从零开始索引节点，而 R 使用基于 1 的索引。再试一次，w <- which(cmem$membership == 0) - 1看看分离物是否持续存在。