python - 如何在 Cygwin 上设置 PYTHONPATH？

Question

在 Biopython 安装说明中，它说如果 Biopython 不起作用，我应该这样做：

导出 PYTHONPATH = $PYTHONPATH':/directory/where/you/put/Biopython'

我尝试在 Cygwin 中使用 Biopython 目录的名称（或它通过 ~ 目录的所有内容）从 ~ 目录中执行此操作，但是当我通过进入 Python 解释器并输入来测试它时

从 Bio.Seq 导入 Seq

它说该模块不存在。

我如何做到这一点，以便我不必在 Biopython 目录中就可以导入 Seq？

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您写了“（或 ~ 目录之后的所有内容）”。我认为您需要使用完整的目录路径。并且~不会在 ':' 之后立即展开，因此请$HOME改用：

导出 PYTHONPATH = $PYTHONPATH":$HOME/directory/where/you/put/Biopython"

（注意使用双引号而不是单引号，因此$HOME被扩展了。）

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您可以将目录添加到sys.path列表中

import sys
biopythondir = '/where/you/put/biopython'
if biopythondir not in sys.path:
  sys.path.append(biopythondir)

# import seq

或者，要获得比使用环境变量和更优雅的解决方案sys.path，请参阅如何使用 .pth 文件来扩展 sys.path。

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