而且我正在努力理解我们是否可以在与 pandas 一起使用时利用 parquet 文件的全部功能。
TL;DR:是的,但你可能需要比使用 Dask 之类的东西更努力地工作。
例如说我有一个大的镶木地板文件(按年分区)
这是迂腐的,但单个镶木地板文件没有在任何东西上进行分区。Parquet“数据集”(文件集合)是分区的。例如:
my_dataset/year=2002/data.parquet
my_dataset/year=2003/data.parquet
在我们调用 df = pd.read_parquet("file.parquet) 的那一刻,它是否会将所有内容都带入内存?
是的。但是......你可以做得更好:
df = pd.read_parquet('/tmp/new_dataset', filters=[[('year','=', 2002)]], columns=['year', 'state', 'gender', 'last_name'])
关键字会将过滤器向下传递给 pyarrow,它会以下filters
推方式将过滤器应用到分区(例如,知道需要读取哪些目录)和行组统计信息。
关键字会将列columns
选择向下传递给 pyarrow,pyarrow 会将选择应用于仅从磁盘读取指定的列。
使用箭头包可以实现这些吗?
pandasread_parquet
文件中的所有内容都由 pyarrow 在幕后处理(除非您更改为其他引擎)。传统上,group_by
然后将由 pandas 直接处理(好吧,也许是 numpy),但是如果你想尝试在 pyarrow 中做所有事情,pyarrow 也有一些实验性的计算 API。
尽管我没有使用 dask 只是想知道这种情况是否在 dask 中处理,因为他们懒惰地执行它。
以我的理解(我没有大量的 dask 经验),当你说......
df_2002 = df[df.year == 2002]
df_2002.groupby(["state", "gender"])["last_name"].count()
...在 dask 数据框中,dask 会发现它可以应用下推过滤器和谓词,并且在加载数据时会这样做。因此,dask 会负责确定您应该应用哪些过滤器以及需要加载哪些列。这使您不必提前自己弄清楚。
完整示例(您可以使用strace
它来验证它仅加载两个镶木地板文件之一,并且仅加载该文件的一部分):
import pyarrow as pa
import pyarrow.dataset as ds
import pandas as pd
import shutil
shutil.rmtree('/tmp/new_dataset')
tab = pa.Table.from_pydict({
"year": ["2002", "2002", "2002", "2002", "2002", "2002", "2003", "2003", "2003", "2003", "2003", "2003"],
"state": [ "HI", "HI", "HI", "HI", "CO", "CO", "HI", "HI", "CO", "CO", "CO", "CO"],
"gender": [ "M", "F", None, "F", "M", "F", None, "F", "M", "F", "M", "F"],
"last_name": ["Smi", "Will", "Stev", "Stan", "Smi", "Will", "Stev", "Stan", "Smi", "Will", "Stev", "Stan"],
"bonus": [ 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11]
})
ds.write_dataset(tab, '/tmp/new_dataset', format='parquet', partitioning=['year'], partitioning_flavor='hive')
df = pd.read_parquet('/tmp/new_dataset', filters=[[('year','=', 2002)]], columns=['year', 'state', 'gender', 'last_name'])
df_2002 = df[df.year == 2002]
print(df.groupby(["state", "gender"])["last_name"].count())
免责声明:您在这里询问了许多技术。我与 Apache Arrow 项目密切合作,因此我的回答可能偏向那个方向。