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我编写了一个 R 脚本，它从 fcs 文件导入数据，通过 FlowSOM 执行聚类，我想检查它并在 t-SNE 上可视化我的数据。它适用于少量数据，但是当我尝试处理大量数据（大约 4000 个单元格）时，它会在达到 310 000 个单元格时崩溃而没有任何错误消息。

out_tsne <- Rtsne(data_Rtsne, 
              perplexity = perp,
              initial_dims = 50,
              max_iter = i, 
              pca=T,
              verbose = T,
              num_threads=0)

data_Rtsne 是一个 4000000*10 的矩阵。

使用较小的数据集（大约 500 000 个单元格），它可以毫无问题地工作。所以应该是内存限制问题。

有人可以向我解释为什么我没有来自 R 的任何错误消息（它关闭，仅此而已）以及为什么我在 Windows 的任务管理器上看不到 RAM 饱和？

提前感谢您的帮助！

编辑：好的，我再次尝试使用较小的数据集（大约 500 000 个单元格），它可以正常工作。所以应该是内存限制问题。有人可以向我解释为什么我没有来自 R 的任何错误消息（它关闭，仅此而已）以及为什么我在 Windows 的任务管理器上看不到 RAM 饱和？

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