我想将数据框转换为 Newick 格式。我试图遵循 data.tree 包中的小插图,但我在输出中得到错误的分支长度,尽管树的形状是正确的。这是我到目前为止所尝试的:
输入表
population = FromDataFrameTable(myDataFrame, pathName = "LineageTracing", colLevels = c("TimeBranching") , na.rm = FALSE)
tree = ToNewick(population, heightAttribute = "TimeBranching")
输出
“(2:-1,3:-5,(6:8)4:-9,5:-10)1;”
它应该是“(2:1,3:5,(6:1)4:9,5:10)1;” 反而。
你知道如何处理这个问题吗?预先感谢您的帮助 !