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我只是想为 Rust ndarray 做基本的数学运算(例如,sin、exp、log、sqrt ...)。但是,通过阅读 ndarray 的文档,我没有找到任何有用的示例。

比如说:

extern crate ndarray;

use ndarray as nd;

fn main() {
    let matrix = nd::array![[1., 2., 3.], [9., 8., 7.]];
    let result = some_math(matrix);
    println!("{}", result)
}

fn some_math(...) {
    //Here I would like to do elementwise exp() and sqrt
    sqrt(exp(...))
    // Using f64::exp would fail.
}

如何some_math有效地实施?我当然可以通过循环遍历矩阵的元素来进行元素操作,但这听起来不太好,我不想这样做。

numpypython 中,这简直就是np.sqrt(np.exp(matrix)). 我的意思是 Rust 确实是一门很棒的语言,但是,即使是简单的代数也很不方便(缺乏适当的生态系统)。


更新:ndarray 正在进行拉取请求。如果这被接受,那么你可以简单地做matrix.exp().sqrt()等。

ndarray-doc 中有一个非常隐藏的页面,告诉您如何进行此类数学运算。


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1 回答 1

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如何some_math有效地实施?

您可以使用mapv_into()

use ndarray as nd;
use ndarray::Array2;

fn some_math(matrix: Array2<f64>) -> Array2<f64> {
    // np.sqrt(np.exp(matrix)) would literally translate to equivalent to
    // matrix.mapv_into(f64::exp).mapv_into(f64::sqrt)
    // but this version iterates over the matrix just once
    matrix.mapv_into(|v| v.exp().sqrt())
}

fn main() {
    let matrix = nd::array![[1., 2., 3.], [9., 8., 7.]];
    let result = some_math(matrix);
    println!("{:?}", result)
}

操场

这应该给你的性能与 的相当numpy,但你应该确定。

要使用对大型阵列有意义的多核,您需要启用rayoncrate 的功能并使用par_mapv_inplace()

fn some_math(mut matrix: Array2<f64>) -> Array2<f64> {
    matrix.par_mapv_inplace(|v| v.exp().sqrt());
    matrix
}

(不在 Playground 上编译,因为 Playgroundndarray不包含该rayon功能。)

请注意,在上面的示例中,如果感觉更自然,您可以替换v.exp().sqrt()f64::sqrt(f64::exp(v))


编辑:我对时间很好奇,所以我决定做一个微不足道的(和不科学的)基准测试——创建一个随机的 10_000x10_000 数组并np.sqrt(np.sqrt(array))与 Rust 等价物进行比较。

用于基准测试的 Python 代码:

import numpy as np
import time

matrix = np.random.rand(10000, 10000)

t0 = time.time()
np.sqrt(np.exp(matrix))
t1 = time.time()

print(t1 - t0)

锈代码:

use std::time::Instant;
use ndarray::Array2;
use ndarray_rand::{RandomExt, rand_distr::Uniform};

fn main() {
    let matrix: Array2<f64> = Array2::random((10000, 10000), Uniform::new(0., 1.));
    let t0 = Instant::now();
    let _result = matrix.mapv_into(|v| v.exp().sqrt());
    let elapsed = t0.elapsed();
    println!("{}", elapsed.as_secs_f64());
}

在我对古老桌面系统的实验中,Python 需要3.7 秒来计算,而 Rust 需要2.5 秒。替换mapv_into()par_mapv_inplace()使 Rust 速度大大加快,现在的时钟速度为0.5 s,比同等 Python 快 7.4 倍。

单线程 Rust 版本更快是有道理的,因为它只迭代整个数组一次,而 Python 会迭代两次。如果我们去掉这个sqrt()操作,Python 的时钟是 2.8 秒,而 Rust 在 2.4 秒时仍然稍微快一些(并且仍然是 0.5 秒并行)。我不确定是否可以在不使用 numba 之类的东西的情况下优化 Python 版本。事实上,在不因手动进行低级计算而导致性能损失的情况下调整代码的能力是像 Rust 这样的编译语言的好处。

多线程版本是我不知道如何在 Python 中复制的东西,但是知道 numba 的人可以做到并进行比较。

于 2021-11-16T14:46:10.907 回答