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我正在使用我的 scRNA-seq 数据关注 URD 教程。(链接:https ://www.cell.com/cms/10.1016/j.neuron.2020.09.023/attachment/c0171ed1-7d01-4029-b0be-2dbba2aa5240/mmc2 )

在按照教程进行操作时,我发现我需要加载 NMF 结果,该结果是通过“将 urd_object@logupx.data 提供给用 Python 编写的外部 NMF 管道来计算的。我基本上想知道如何在 Python 中从我的 URD 对象计算 NMF用哪个包..

我需要帮助来搜索用于 NMF 计算的易于遵循的包。

先感谢您!

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