0

我正在分析安捷伦微阵列 44k 双色全基因组数据。我之前在相同的数据上使用了相同的代码，但是当我用不同的条件重新分析时。我收到以下错误。除了上一个，我还更新了 R 并使用了最新的 4.1.1。我已经尝试了与我的错误相关的所有建议。所有文件都在同一个文件夹中，setwd() 可以通过 getwd() 重新检查。

文件中的错误（文件，“r”）：无法打开连接另外：警告消息：在文件（文件，“r”）中：无法打开文件'directory/sample1.txt'：没有这样的文件或目录

使用的代码：

目录 <- "D:/agilent/" setwd("D:/agilent/") getwd() [1] "D:/agilent" library(limma) 目标 <- readTargets("targets.txt", sep = ' \t') x <- read.maimages(targets, path="directory", source="agilent",green.only=TRUE) 文件错误（文件，“r”）：无法打开连接另外：警告消息：在文件中（文件，“r”）：无法打开文件'directory/sample1.txt'：没有这样的文件或目录

输入目标文件：

SampleNumber    FileName    Condition
1   sample1.txt AML
2   sample2.txt AML
3   sample3.txt AML
4   sample4.txt ALL
5   sample5.txt ALL

请为此提供解决方案。

4

0 回答 0