在我将 MRI DICOM 图像转换为 NIfTI 格式后,面具不在正确的位置。在文件格式转换之前,掩码在正确的位置(sella 区域)。掩码一开始是 mha 格式,然后转换为 NIfTI 文件。但是,即使将掩码转换为 NIfTI 格式,它仍然在错误的位置。
`def transform(input_names, out_path, name):
converter = Dcm2niix()
converter.inputs.source_names = input_names
# converter.inputs.compression = 5
converter.inputs.out_filename = name
converter.inputs.output_dir = out_path
# converter.inputs.merge_imgs = True
cmd=converter.cmdline
os.system(cmd)`
img_mask=sitk.ReadImage(mask_file)
sitk.WriteImage(img_mask,outpath+pt_name+'_mask.nii.gz')