r - 结合dtplyr和multidplyr处理大型mutate操作

Question

我正在组合dtplyr和multidplyr库来处理在一个非常大的数据库上执行的一些基本的变异/汇总操作。final_db_partition，合并后有时是 30m 行长。

我不知道我是否做错了什么，但 R 会话被中止或我完成了我的记忆。

R 版本 4.0.5 (2021-03-31) / 平台：x86_64-apple-darwin17.0 (64-bit) / 运行于：macOS Big Sur 10.16

我应该如何解决这个问题？

library(multidplyr)
library(dtplyr)
library(dplyr, warn.conflicts = FALSE)
library(data.table)
library(stringr)


default_cluster(parallel::detectCores()-1)
cluster_library(default_cluster(), 'dplyr')
cluster_library(default_cluster(), 'stringr')

db1 <- db1 %>% 
    data.table::data.table() %>% 
    lazy_dt(immutable = FALSE) 
  
  db2 <- db2 %>% 
    data.table::data.table() %>% 
    lazy_dt(immutable = FALSE)  

final_db_partition <- db1 %>% 
    left_join(db2)  %>% 
    as.data.frame() %>% 
    group_by(id) %>% 
    partition(cluster = default_cluster()) 

final_db <- final_db_partition %>% 
    as.data.table() %>% 
    #lazy_dt(immutable = FALSE)  %>% 
    mutate(m1=ifelse(stringi::stri_detect_regex(m_destination, paste0("\\b", m_origin,"\\b")),1,0)) %>% 
    as.data.frame() %>% 
    group_by(across(c(-v1,-v2,-v3))) %>% 
    summarise(finalv1 = sum(finalv1,na.rm=T),
              finalv2 = sum(finalv2,na.rm=T)) %>% 
    collect()