以示例库中的原子轨道示例为基础,我尝试使用等值面可视化 3D 任意复杂场,就像循环 HSV 颜色图说明场的相位一样。但是,在相位场取值pi
和附近的点存在问题-pi
,在下图中,对应于红色:
在这些点中, 和 之间存在明显的不连续性pi
,-pi
并且 mayavi 似乎在这些值之间进行插值,这导致上图中出现“噪声色线”。
我的问题:有没有办法解决这个问题,例如,通过禁用颜色插值?
重现情节的代码:
import numpy as np
from mayavi import mlab
L = 1.0
N = 150
xx, yy, zz = np.mgrid[-L:L:N*1j, -L:L:N*1j, -L:L:N*1j]
= 0.0
σ = 0.30
V = np.exp((-(xx-)**2 -(yy)**2 -(zz)**2 ) / (2*σ**2))
density = V/np.amax(np.abs(V))
phi = np.arctan2(yy,xx)
density = density *np.exp(6*phi*1j)
figure = mlab.figure('Phase Plot',bgcolor=(0, 0, 0), size=(700, 700))
field = mlab.pipeline.scalar_field(np.abs(density),vmin= 0.0 ,vmax= 1.0)
colour_data = (np.angle(density.T.ravel()))
field.image_data.point_data.add_array(colour_data)
field.image_data.point_data.get_array(1).name = 'phase'
field.update()
field2 = mlab.pipeline.set_active_attribute(field, point_scalars='scalar')
contour = mlab.pipeline.contour(field2)
contour.filter.contours= [0.1,]
contour2 = mlab.pipeline.set_active_attribute(contour,
point_scalars='phase')
mlab.pipeline.surface(contour2, colormap='hsv', vmin= -np.pi ,vmax= np.pi)
mlab.colorbar(title='Phase', orientation='vertical', nb_labels=3)
φ = 30
mlab.view(azimuth= φ, distance = N*4)
mlab.show()
我正在考虑解决此问题的另一种方法是使用此函数手动设置表面上的颜色,该函数从复杂数组 Z 返回一个 RGB 颜色数组:
from matplotlib.colors import hsv_to_rgb
import numpy as np
def complex_to_rgb(Z):
r = np.abs(Z)
arg = np.angle(Z)
h = (arg + np.pi) / (2 * np.pi)
s = np.ones(h.shape)
v = r / np.amax(r) #alpha
c = hsv_to_rgb( np.moveaxis(np.array([h,s,v]) , 0, -1) ) # --> tuple
return c
但是,我不知道是否有 mayavi 内置方法允许直接输入具有表面 RGB 颜色的数组。