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非常感谢您的意见、建议或解决方案，谢谢。

我正在使用fpcR 中的包对一些非常密集的数据（范围 -3、6 之间的 3 组 40,000 个点）进行 dbscan 分析。

我发现了一些集群，我只需要绘制重要的集群。问题是我有一个集群（第一个），其中包含大约 39,000 个点。我需要绘制除此之外的所有其他集群。

它dbscan()创建了一个特殊的数据类型来存储所有这些集群数据。它不像数据框那样被索引（但也许有一种方法来表示它？）。

我可以使用基本plot()调用绘制 dbscan 类型。但是，就像我说的，这将绘制不相关的 39,000 个点。

tl; dr：我如何仅绘制dbscan数据类型的特定集群？

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如果您查看帮助页面?dbscan（Value 部分描述了函数dbscan返回的内容。在这种情况下，它只是一个包含几个组件的列表（标准 R 数据类型）。

该cluster组件只是一个整数向量，其长度等于数据中的行数，表示每个观测值属于哪个集群。因此，您可以使用此向量对数据进行子集化，以仅提取您想要的那些集群，然后仅绘制这些数据点。

例如，如果我们使用帮助页面中的第一个示例：

set.seed(665544)
n <- 600
x <- cbind(runif(10, 0, 10)+rnorm(n, sd=0.2), runif(10, 0, 10)+rnorm(n,
    sd=0.2))
ds <- dbscan(x, 0.2)

然后我们可以使用结果，ds仅绘制集群 1-3 中的点：

#Plot only clusters 1, 2 and 3
plot(x[ds$cluster %in% 1:3,])
于 2011-07-26T15:14:40.123 回答
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在不了解具体情况的情况下dbscan，我可以建议你看一下函数smoothScatter。当您有太多点无法理解数据时，它对于检查散点图中的主要模式非常有用。

于 2011-07-26T09:44:42.340 回答
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绘制结果的最明智的方法可能DBSCAN是使用 alpha 形状，并将半径设置为 epsilon 值。Alpha 形状与凸包密切相关，但它们不一定是凸包。alpha 半径控制允许的非凸面量。

这与密度连接对象的集群模型密切相关，DBSCAN因此将为您提供对集合的有用解释。

由于我没有使用R，我不知道R. 据说有一个名为 的包alphahull，来自谷歌的快速检查。

于 2012-03-01T19:24:46.963 回答