r - 如何对超过 2 个数据块进行 PLS（混合组学）？

Question

我正在用 Mixomics 包做 PLS。我有 2 个数据块，Performances 和 MethodesAlter。

代码：

Y <- Performances
X3 <- MethodesAlter 
rownames(X3) <- rownames(Y)
pls1 <- pls(X3, Y, ncomp=4, mode = "canonical")
plotVar(pls1)

但它只适用于 2 个数据块，我想知道，如何对 3 个或 4 个数据块做同样的事情？什么包允许这样做？我是 PLS 的初学者：/

感谢我们的帮助。

Answer 1

答案很晚，但是如果您想使用具有多个块 (>2) 的偏最小二乘法，您可以使用mixOmicsblock.pls包的功能（或者如果您想集成稀疏约束）。这个函数允许回归一个连续的 Y 矩阵。如果要回归分类变量，例如可以使用同源函数。您将在这里找到一些在方法上下文中使用 R 代码的示例：block.splsblock.plsdablock.plsda

https://mixomicsteam.github.io/Bookdown/diablo.html