我正在尝试使用 samtools 排序功能对一个不大的 bam 文件(命名为 PT2)(大小 180 兆)进行排序。排序永远不会结束,也不会出现错误消息。我已经使用(家庭帐户的 proc 文件夹中的 meminfo 文件)检查了 VM Ubunto 的内存。我还有大约 80 个演出磁盘空间
第一个代码:samtools sort -o outputs/PT2_sorted.bam outputs/PT2.bam(非常慢wwww)
第二个代码:samtools sort -o outputs/PT2_sorted.bam outputs/PT2.bam(非常慢)
您认为这种缓慢工作背后的原因是什么?有什么建议吗?
谢谢