0

我是 R 的初学者，使用 prcomp 执行 PCA，除了默认行号之外，无法获得任何标记的点。我的档案是不同地点的物种存在和缺失。例如在这里，我设置了一个小测试文件，我想使用 SITES 列中的标签来标记我在 biplot 中的点。

> head(testfile2)
# A tibble: 6 x 7
  SITES   sp1   sp2   sp3   sp4   sp5   sp6
  <chr> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl> <dbl>
1 A1        1     1     1     1     1     1
2 A2        0     1     1     1     1     0
3 B1        0     1     1     1     1     1
4 C         1     1     1     1     1     0
5 D         0     0     1     1     0     1
6 E         1     0     1     1     1     0

然后当我尝试设置行名时，我收到以下错误消息

> row.names(testfile2)<-testfile2[,1]
Error in `.rowNamesDF<-`(x, value = value) : invalid 'row.names' length
# In addition: Warning message:
Setting row names on a tibble is deprecated.

但是我可以成功运行 PCA，但没有我需要 prcomp biplot的标签

我检查了行名，没有一个是重复的。我在设置行名时做错了什么？我搜索了 stackoverflow 和其他网站，并看到了类似的问题。我已经尝试了建议的解决方案，但未能解决问题。我希望这是显而易见的事情，但经过长时间的搜索，我被难住了。

解决方案是在 PRCOMP 和 BIPLOT 指令模型之间设置行名 <-prcomp(testfile2[,-1],scale=TRUE)

摘要（型号）

行名<-testfile2$SITES

双标图（模型）

4

0 回答 0