对于生存分析,我使用mlr3proba
R 包。
我的数据集由 39 个特征(连续和因子,我将其全部转换为整数和数字)和目标(时间和状态)组成。
我想调整超参数:num_nodes,在Param_set
.
这是一个ParamUty
具有默认值的类参数:32,32
.
所以我决定改造它。
我编写了如下代码,用于surv.deephit
使用“嵌套交叉验证”(具有 10 个内部折叠和 3 个外部折叠)对学习器进行超参数优化。
#task definition
task.mlr <- TaskSurv$new(id = "id", backend = main.dataset, event = 'status', time = 'time')
#learner definition
dh.learner <- lrn('surv.deephit')
#resampling method
resampling <- rsmp('cv', folds =10)
#tuner method
tuner <- tnr('random_search')
#measure method
measure <- msr('surv.harrellC')
#termination method
terminator <- trm('stagnation')
#search_space definition(for num_nodes)
search_space <- ps(num_nodes = p_fct(list(c(32,64,128,256)), trafo = function(x) c(sample(x,1), sample(x,1))))
#To check search_space
generate_design_random(search_space,10)$transpose()
当我用 transpose 运行最后几行代码时,它展示了一个 num_nodes 列表,每个包含一个成对的类别,如下所示:
[[1]]$num_nodes
[1] 64 128
[[2]]$num_nodes
[1] 32 256
...
然后我写了以下代码:
#defining autotuner
at <- AutoTuner$new(dh.learner, resampling, measure, terminator, tuner, search_space)
#outer cross validation
resampling_outer <- rsmp('cv', folds = 3)
# nested resampling
nest_rsm <- resample(task.mlr, at, resampling_outer)
但在嵌套重采样的结果中,它显示 num_nodes 为 ,而不是节点对c(32,64,128,256)
。像这样的东西:
num_nodes
c(32,64,128,256)
num_nodes
c(32,64,128,256)
...
如何用 2 个级别(例如32,64
)转换“Param_Uty”?
老实说,我已经大量搜索了这个主题,毕竟我没有找到合适的答案,所以我感谢你的帮助。