library(mlr3verse)
preformace_msr <- msr("classif.fbeta", beta = 1.5)
我正在尝试在 fbeta 度量中使用 BETA 的自定义值来调整分类模型。
但是上述试图给出 beta 值的方式在 mlr3 中会引发错误。
在 mlr3 中正确的做法是什么?
library(mlr3verse)
preformace_msr <- msr("classif.fbeta", beta = 1.5)
我正在尝试在 fbeta 度量中使用 BETA 的自定义值来调整分类模型。
但是上述试图给出 beta 值的方式在 mlr3 中会引发错误。
在 mlr3 中正确的做法是什么?
所以错误如下:
library(mlr3verse)
preformace_msr <- msr("classif.fbeta", beta = 1.5)
#> Error: Cannot set argument 'beta' for 'MeasureBinaryimple' (not a constructor argument, not a parameter, not a field.
我认为这与只有 F1-Measure(不是 F1.5-measure 等)在mlr3
. 见beta=1
源文件。
在mlr3 书中,您将在 6.3 下找到以下内容:
在本节中,我们展示了如何实现自定义性能度量。
根据本节,您可以使用以下方法实现 Fx-Measure(我认为我的语法不是最好/最安全的,但它应该可以工作):
library(mlr3verse)
library(mlr3measures)
library(R6)
# make custom measure:
MeasureCustomFbeta = R6::R6Class("classif.custom_fbeta",
inherit = mlr3::MeasureClassif,
public = list(
#declase field
beta=NULL, #delcare field
initialize = function(beta) {
self$beta <- beta
super$initialize(
# custom id for the measure
id = "custom_fbeta",
# required predict type of the learner
predict_type = "response",
# feasible range of values
range = c(0, Inf),
# minimize during tuning?
minimize = TRUE
)
}
),
private = list(
# customized scoring function operating on the prediction object
.score = function(prediction, ...) {
fbeta_cm = function(m, beta) {
pred_pos = sum(m[1L, ])
cond_pos = sum(m[, 1L])
if (m[1L, 1L] == 0L || pred_pos == 0L || cond_pos == 0L)
return(na_value)
P = m[1L, 1L] / pred_pos
R = m[1L, 1L] / cond_pos
((1 + beta^2) * P * R) / ((beta^2 * P) + R)
}
fbeta_cm(confusion_matrix(prediction$truth, prediction$response, prediction$positive)$matrix, self$beta)
})
)
# add it to the dictionary
mlr3::mlr_measures$add("classif.custom_fbeta", MeasureCustomFbeta)
测试:
# get data
data("Sonar", package = "mlbench")
# make task
task = TaskClassif$new(id = "Sonar", Sonar, target = "Class", positive = "R")
# make learner
learner = lrn("classif.rpart", predict_type = "response")
# predict
pred = learner$train(task)$predict(task)
pred$confusion
#> truth
#> response R M
#> R 87 16
#> M 10 95
# measure "classif.beta
measure_old <- msr("classif.fbeta")
pred$score(measure_old)
#> classif.fbeta
#> 0.87
# customized measure
measure_new <- msr("classif.custom_fbeta", beta=1.5)
pred$score(measure_new)
#> classif.custom_fbeta
#> 0.8801556
到目前为止,措施还没有参数。将在下一个版本中通过https://github.com/mlr-org/mlr3/pull/623解决。