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我正在使用 Matplotlib(版本 2.2.5)绘制大量有错误的数据点,并且我正在对数据进行栅格化,因为有几千个数据点。然而,我发现当我将数据栅格化并另存为 PDF 时,错误栏会产生一个难看的白色轮廓,这对于发布是不可接受的。我构建了一个显示问题的 MWE:

import numpy as np
import random as rand
import matplotlib.pyplot as plt

rand.seed(10)
seeds = range(0, 1000)
data = np.empty((len(seeds), 2))
for n in seeds:
    data[n, 0] = rand.gauss(1, 0.01)
    data[n, 1] = rand.gauss(1, 0.01)

fig, ax = plt.subplots(1, 1, figsize=(6, 6))

ax.scatter(data[:, 0], data[:, 1], s=10, facecolors="k", rasterized=True, zorder=1)
ax.errorbar(data[:, 0], data[:, 1], xerr=0.01, yerr=0.01, color="k", fmt="none", rasterized=True, zorder=2)

fig.savefig("Test.pdf", dpi=250)

这在 Jupyter Notebook 输出中看起来很好,也可以作为保存的 PNG 文件。然而,输出的 PDF 文件看起来像这样: PDF输出 如何消除由错误栏引起的白色绒毛?如果我不进行光栅化,问题就会消失,但是文件需要很长时间才能加载到我的论文中,而我最不想做的事情就是惹恼我的读者。

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由于一个较旧的问题,我找到了解决方案:我需要添加ax.set_rasterization_zorder(0)到代码中并将绘制点的 zorder 更改为低于 0。这产生了一个完美的图表,它没有丑陋的数据轮廓并保留了一个矢量化轴,正是我想要什么。工作代码是:

import numpy as np
import random as rand
import matplotlib.pyplot as plt

rand.seed(10)
seeds = range(0, 1000)
data = np.empty((len(seeds), 2))
for n in seeds:
    data[n, 0] = rand.gauss(1, 0.01)
    data[n, 1] = rand.gauss(1, 0.01)

fig, ax = plt.subplots(1, 1, figsize=(6, 6))

ax.scatter(data[:, 0], data[:, 1], s=10, facecolors="k", rasterized=True, zorder=-2)
ax.errorbar(data[:, 0], data[:, 1], xerr=0.01, yerr=0.01, color="k", fmt="none", rasterized=True, zorder=-1)

ax.set_rasterization_zorder(0)

fig.savefig("Test.pdf", dpi=250)

输出是:新的测试输出

于 2021-03-02T00:40:26.987 回答