PaulM和我一起研究了一个解决方案,并设法加快了其中一个选项的速度:涉及在线迷你图的选项。事实证明,基于一些分析工作,使该过程特别缓慢的不是绘制迷你图本身,而是从 R 中翻译它们以便将它们合并到 HTMLreactable
表中的后续工作。
因此,为了完全绕过这个缓慢的翻译过程,我们编写了一个代码模板,它将包裹在要绘制的数据点周围。这就是我们随后直接提供给 的内容reactable
,以及一个html = TRUE
参数,以便将代码解释为这样,而不是作为常规文本。
之后的最后一个障碍是确保即使用户对列进行排序或导航到不同的结果页面,迷你图(每行一个)仍然显示 - 通常迷你图会在以这种方式与表格交互时消失。为此,我们确保reactable
在任何点击后 10 毫秒都会重新绘制。
这是一个包含在其中的示例,shiny
它显示了所有这些在行动中,以及旧(慢)版本。对我来说,加速版本大约在 0.5 秒内渲染,而旧版本 - 大约 13 秒。
library(reactable)
library(magrittr)
library(plotly)
library(sparkline)
library(shiny)
library(shinycssloaders)
library(shinyWidgets)
if (interactive()) {
# Init objects
t0 <- NULL
t1 <- NULL
my_diamonds <- diamonds
my_diamonds$cats <- cut(my_diamonds$price, 850)
my_diamonds <- my_diamonds[ order(my_diamonds$cut, my_diamonds$cats), ]
data <- unique(my_diamonds[, c("cut", "cats")])
data_parcels <- split(my_diamonds, list(my_diamonds$cats, my_diamonds$cut), drop = T)
data$nested_points <- sapply(data_parcels, '[[', 'y')
data$sparkline <- NA
ui <- shinyUI(
basicPage(
br(),
radioGroupButtons(
inputId = "speedChoice",
label = "Speed",
choices = c("Fast", "Slow"),
status = "danger"
),
br(),
verbatimTextOutput("timeElapsed"),
br(),
shinycssloaders::withSpinner(
reactableOutput("diamonds_table")
),
# Small JS script to re-render a reactable table so that the sparklines show
# after the user has modified the table (sorted a col or navigated to a given page of results)
tags$script('document.getElementById("diamonds_table").addEventListener("click", function(event){
setTimeout(function(){
console.log("rerender")
HTMLWidgets.staticRender()
}, 10);
})
')
)
)
server <- function(input, output, session) {
output$diamonds_table <- renderReactable({
if (input$speedChoice == "Fast") {
t0 <<- Sys.time()
part1 <- '<span id="htmlwidget-spark-' # + ID
part2 <- '" class="sparkline html-widget"></span><script type="application/json" data-for="htmlwidget-spark-' # + ID
part3 <- '">{"x":{"values":[' # + values
part4 <- '],"options":{"height":20,"width":60},"width":60,"height":20},"evals":[],"jsHooks":[]}</script>'
out <- list(length = nrow(data))
for (i in 1:nrow(data)) {
vals <- paste0(data$nested_points[[i]], collapse = ',')
out[[i]] <- paste0(part1, i, part2, i, part3, vals, part4)
}
data$sparkline <- out
tab <- reactable(data,
columns = list(
sparkline = colDef(html = TRUE,
cell = function(value, index) {
return(htmltools::HTML(value))
}
)
)
) %>%
spk_add_deps() %>%
htmlwidgets::onRender(jsCode = "
function(el, x) {
HTMLWidgets.staticRender();
console.log('render happening')
}")
t1 <<- Sys.time()
return(tab)
} else {
# Classic, but slow version:
t0 <<- Sys.time()
tab <- reactable(data,
columns = list(
sparkline = colDef(cell = function(value, index) {
data$nested_points[[index]] %>%
sparkline::sparkline()
}
)
)
)
t1 <<- Sys.time()
return(tab)
}
})
output$timeElapsed <- renderText({
input$speedChoice # Connect to reactable update cycle
return(t1 - t0)
})
}
shinyApp(ui = ui, server = server)
}