所以我正在使用带有 mlxtend 包的 SVM 执行特征选择。X 是具有特征的数据框,y 是目标变量。这是我的代码的一部分。
from sklearn.svm import SVC
from mlxtend.feature_selection import SequentialFeatureSelector as SFS
def SFFS(X, y, C_GS, gamma_GS, kernel_GS):
sfs = SFS(SVC(kernel = kernel_GS, C = C_GS, gamma = gamma_GS),
k_features = (1, num_of_features),
forward= True,
floating = False,
verbose= 2,
scoring= 'roc_auc',
#scoring= 'accuracy',
cv = 10,
n_jobs= -1
).fit(X, y)
return sfs
def SFFS_lin(X, y, C_GS, kernel_GS):
sfs = SFS(SVC(kernel = kernel_GS, C = C_GS),
k_features = (1, num_of_features),
forward= True,
floating = False,
verbose= 2,
scoring= 'roc_auc',
cv = 10,
n_jobs= -1
).fit(X, y)
return sfs
def featureNames(sfs):
Feature_Names = sfs.k_feature_names_
return Feature_Names
sfs_lin = SFFS_lin(X, y, 1,'linear')
#sfs_rbf = SFFS(X, y, 1, 'auto', 'rbf')
names = featureNames(sfs_lin)
print(names)
代码开始运行,但很快它就冻结在这里:
[Parallel(n_jobs=-1)]:使用后端 LokyBackend 和 8 个并发工作人员。[并行(n_jobs=-1)]:完成 28 个,共 28 个 | 已用:剩余 2.5 秒:0.0 秒 [并行(n_jobs=-1)]:完成 28 个,共 28 个 | 经过:2.5秒完成
[2021-01-24 00:01:57] 特点:1/28 -- 得分:0.6146428161908037[Parallel(n_jobs=-1)]:使用后端 LokyBackend 和 8 个并发工作人员。
使用 rbf 内核时,代码运行良好。如果我通过将forward参数设置为 False来更改函数以执行向后消除,它运行得很好
前进=假,
它运行得很漂亮。使用线性核进行前向选择时似乎会出现冻结问题。这是一个愚蠢的错误还是我错过了一些微不足道的东西?
系统信息:
Python 3.8.5
scikit-learn 0.24.1
mlxtend 0.18.0