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当我尝试在运行 Python 3 的 Jupyter Notebook 中将地理数据框的几何图形从 EPSG4326 转换为 EPSG3857 时，我的内核一直在死机。

最小的可重现代码：

df = pd.DataFrame(
    {'City': ['A', 'B', 'C', 'D', 'E'],
     'Country': ['1', '2', '3', '4', '5'],
     'Latitude': [-34.58, -15.78, -33.45, 4.60, 10.48],
     'Longitude': [-58.66, -47.91, -70.66, -74.08, -66.86]})

crs = {'init': 'epsg:4326'}

gdf = gpd.GeoDataFrame(
    df, crs=crs, geometry=gpd.points_from_xy(df.Longitude, df.Latitude))

gdf.geometry = gdf.geometry.to_crs(epsg=3857)

我已经在这个已关闭的 Github 问题中尝试了解决方案- 即更新到最新版本的 PyProj。这并不能解决我的问题。

我还尝试为 geopandas 创建一个新的、专用的 conda 环境。这也不能解决我的问题。

当我在 python 终端脚本中运行最小的可重现代码时，我得到以下输出，表明 Fiona 存在问题。

(geo) RichardgrimsMBP:desktop data_science$ python tocrs.py
Traceback (most recent call last):
File "tocrs.py", line 4, in
import geopandas as gpd
File "/opt/anaconda3/envs/geo/lib/python3.8/site-packages/geopandas/init.py", line 7, in
from geopandas.io.file import _read_file as read_file # noqa
File "/opt/anaconda3/envs/geo/lib/python3.8/site-packages/geopandas/io/file.py", line 7, in
import fiona
File "/opt/anaconda3/envs/geo/lib/python3.8/site-packages/fiona/init.py", line 86, in
from fiona.collection import BytesCollection, Collection
File "/opt/anaconda3/envs/geo/lib/python3.8/site-packages/fiona/collection.py", line 11, in
from fiona.ogrext import Iterator, ItemsIterator, KeysIterator
ImportError: dlopen(/opt/anaconda3/envs/geo/lib/python3.8/site-packages/fiona/ogrext.cpython-38-darwin.so, 2): Symbol not found: _CCCryptorGCMFinalize
Referenced from: /opt/anaconda3/envs/geo/lib/libtiledb.dylib (which was built for Mac OS X 10.13)
Expected in: /usr/lib/libSystem.B.dylib
in /opt/anaconda3/envs/geo/lib/libtiledb.dylib
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我设法通过在我的 conda 环境中固定旧版本的 tiledb (2.0.8) 来解决问题。conda 求解器似乎存在问题，忽略了我的 macOS 版本（10.11.6）并给了我一个不兼容的 tiledb（2.1.2）版本。

请参阅此处和此处的github 问题。

于 2020-11-05T10:09:28.450 回答