有没有办法为fviz_pca_biplot()
R 包 FactoExtra 中的变量指定形状?
例如我有以下代码:
data("iris")
PCA.iris <- prcomp(iris[ , -5], scale=TRUE)
BiPlot<- fviz_pca_biplot(PCA.iris,
geom = c("point", "text"),
geom.var = c("point", "text"),
palette="ucscgb",
label="var",
col.ind=iris$Species,
invisible="quali",
pointshape = 19, pointsize = 3) +
labs(colour= "Species" )+
theme_gray() +
theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5,size = 20, face = "bold"),
legend.title = element_text(size = 12),
legend.text = element_text(size = 8),
legend.key.size = unit(0.5,"line") )+
guides(shape = guide_legend(override.aes = list(size = 4)),
color = guide_legend(override.aes = list(size = 4)) )
print(BiPlot)
但它使var和ind的形状相同,我希望var的形状不同(形状 15)。当 geom.var = c("point", "text") 设置为 point 时,参数“pointshape”似乎同时适用于var和ind 。
我试过使用scale_shape_manual()
:
BiPlot+
scale_shape_manual(values=15)
但它不适用,我猜这是由于geom中的“点”使用geom_point,我无法指定我想应用它的点,但这只是一个疯狂的猜测。
是否可以将var和ind的pointshape 设置为不同的值,然后如何完成?