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我正在为 XNAT 开发一个 python Rest API，用于将数据传输到本地或服务器。我正在尝试将与项目的一个主题相关的所有实验（数据格式，例如：CT、MR、ECOG、MEEG）从 XNAT 下载到我的本地文件系统。但我只能下载该主题的 MR & CT 会话（Dicom 文件）数据格式的实验。您可以在下面看到我的 python 代码，请让我知道我必须进行的更改。

import xnat
import os
#creating a session
session = xnat.connect('https://xnat.prj.ae.mpg.de', user='xxxx', password='xxxx')
test_project = session.projects["Test"] #loading a project Test
test_subject = test_project.subjects #loading subjects of project
download_folder = os.path.expanduser(r"C:\Users\rkls\Documents\Python-Restapi") # download path
print('Your data is downladed in this directory {} '.format(download_folder))
if not os.path.exists(download_folder):
    os.makedirs(download_folder)
test_project.subjects['S2_RS'].download_dir(download_folder) # using download_dir() to download subject S2_RS
session.disconnect()

现在上面的代码只给了我 CT、MR 会话数据（DICOM 文件）的实验，而不是 ECOG 和 MEEG 会话数据（EDF 和 FIF 文件）。如何下载与项目的单个主题相关的所有实验？

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ECOG和MEEG会话数据包含在什么样的实验中，即数据类型是什么？或者它们只是与主题相关的资源？

我创建了一个具有关联 MR 会话以及一些资源的主题（例如，在主题页面上打开管理文件，创建一个资源文件夹，并将几个 PDF 上传到新的资源文件夹）。SubjectData类上的download_dir()函数只下载实验而不是与主题相关的资源。为此，您需要直接迭代资源：

# Set subject to variable for convenience
s2_rs = test_project.subjects['S2_RS']
s2_rs.download_dir(download_folder) # Download experiment data
for resource_id in s2_rs.resources: # Iterate subject resources
    # Download resources for 
    s2_rs.resources.data[resource_id].download_dir(download_folder)

我在我的主题上创建了一个名为FOO的资源文件夹，然后在那里上传了几个 PDF。在我的下载文件夹中，我得到以下内容：

S2_RS/resources/FOO/files/foo-1.pdf
S2_RS/resources/FOO/files/foo-2.pdf
S2_RS/S2_RS_MR01/...

S2_RS_MR01是我上传的 MR 会话，所以该文件夹下有一堆文件。

如果download_dir()函数也包含资源，那就太好了，但现在这应该可以为您解决这个问题。

于 2020-10-08T22:52:13.737 回答