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我正在研究基于分子的图分类问题。我的数据是 SMILES,我想将其转换为图形并使用 DGL 包构建模型。

我已经在 spyder 中使用pip install dgl安装了 dgl 包,并且!在谷歌 colab 中安装dgl。我可以使用import dgl导入这个包,但是当我使用from dgl.data.chem import mol_to_bigraph, smiles_to_bigraph时,它给了我这个错误:

没有名为“dgl.data.chem”的模块

这里有什么问题?有没有人有修复此错误的经验?谢谢。

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我不确定化学数据集是否存在。我安装了 dgl 包,它不在我可以看到的 dgl/data 目录中。我也没有在 dgl docs中看到它。

数据目录

于 2020-09-26T05:22:10.577 回答
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他们把它们搬到了分馆 DGL Life。

签出此文档。

https://lifesci.dgl.ai/api/utils.mols.html

于 2021-07-29T14:28:29.653 回答