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我需要提取 3D 指纹的脊和谷。输出应该是一个 ply 文件,它使用不同的颜色准确显示 3d 指纹上的脊和谷在哪里。

输入文件- 只有 x、y、z 位置的层文件。我是从 3d 扫描仪中得到的。这是文件的前几行的样子 -

ply
format ascii 1.0
comment VCGLIB generated
element vertex 6183
property float x
property float y
property float z
end_header
-32.3271 -43.9859 11.5124
-32.0631 -43.983 11.4945
12.9266 -44.4913 28.2031
13.1701 -44.4918 28.2568
13.4138 -44.4892 28.2531
13.6581 -44.4834 28.1941
13.9012 -44.4851 28.2684
...     ...      ...       

如果您需要数据 - 请发送电子邮件至nisha.m234@gmail.com给我。

算法: 我正在尝试找到用于提取山脊和山谷的主曲率。

我遵循的步骤是:

  1. 取点 x
  2. 找到它的 k 个最近邻。我使用了从 3 到 20 的 k。
  3. 平均 k 个最近的邻居 => 给出 (_x, _y, _z)
  4. 计算协方差矩阵
  5. 现在我取这个协方差矩阵的特征值和特征向量
  6. 我从特征向量中得到 u、v 和 n。u 是对应于最大特征值的向量 v 对应于第二大 n 是对应于最小特征值的第三小向量
  7. 然后为了转换 point(x,y,z) 我计算矩阵 T
    T = 
      | ui |     |u |     |x - _x| 
      | vi |  =  |v |  x  |y - _y|
      | ni |     |n |     |z - _z|
  8. 对于 k 个最近邻居中的每个 i:
      | n1 |   |u1*u1  u1*v1  v1*v1| | a |
    | n2 | = |u2*u2 u2*v2 v2*v2| | b |
    |... | | ... ... ... | | c |
    | nk | |uk*uk uk*vk vk*vk|
    用最小二乘法求解 a、b 和 c
  9. 这个方程会给我 a,b,c
  10. 现在我计算矩阵的特征值
    | a b |
    | b a |
  11. 这会给我2个特征值。一个是 Kmin,另一个是 Kmax。

我的问题: 输出远未找到正确的山脊和山谷。我完全陷入困境和沮丧。我不确定我到底在哪里弄错了。我认为法线的计算不正确。但我不确定。我对图形编程非常陌生,所以这些数学、法线、着色器超出了我的想象。任何帮助将不胜感激。 请帮忙!!

资源: 我正在使用 Visual Studio 2010 + Eigen 库 + ANN 库。

使用的其他选项 我尝试使用 MeshLab。我在 MeshLab 中使用了球旋转三角形重新网格化,然后应用了 polkadot3d 着色器。如果正确识别山脊和山谷。但我无法对其进行编码。

My Function: //函数输出到ply文件

void getEigen()
{

int nPts; // actual number of data points
ANNpointArray dataPts; // data points
ANNpoint queryPt; // query point 
ANNidxArray nnIdx;// near neighbor indices 
ANNdistArray dists; // near neighbor distances 
ANNkd_tree* kdTree; // search structure

//for k = 25 and esp = 2, seems to got few ridges
queryPt = annAllocPt(dim);                  // allocate query point
dataPts = annAllocPts(maxPts, dim);         // allocate data points
nnIdx = new ANNidx[k];                      // allocate near neigh indices
dists = new ANNdist[k];                     // allocate near neighbor dists
nPts = 0;                                   // read data points

ifstream dataStream;
dataStream.open(inputFile, ios::in);// open data file
dataIn = &dataStream;

ifstream queryStream;
queryStream.open("input/query.pts", ios::in);// open data file
queryIn = &queryStream; 

while (nPts < maxPts && readPt(*dataIn, dataPts[nPts])) nPts++;

kdTree = new ANNkd_tree(                    // build search structure
                dataPts,                    // the data points
                nPts,                       // number of points
                dim);                       // dimension of space

while (readPt(*queryIn, queryPt))           // read query points
{   
    kdTree->annkSearch(                     // search
            queryPt,                        // query point
            k,                              // number of near neighbors
            nnIdx,                          // nearest neighbors (returned)
            dists,                          // distance (returned)
            eps);                           // error bound

    double x = queryPt[0];
    double y = queryPt[1];
    double z = queryPt[2];
    double _x = 0.0;
    double _y = 0.0;
    double _z = 0.0;

    #pragma region Compute covariance matrix

    for (int i = 0; i < k; i++) 
    {
        _x += dataPts[nnIdx[i]][0];
        _y += dataPts[nnIdx[i]][1];
        _z += dataPts[nnIdx[i]][2];
    }       

    _x = _x/k; _y = _y/k; _z = _z/k;

    double A[3][3] = {0,0,0,0,0,0,0,0,0};

    for (int i = 0; i < k; i++) 
    {
        double X = dataPts[nnIdx[i]][0];
        double Y = dataPts[nnIdx[i]][1];
        double Z = dataPts[nnIdx[i]][2];

        A[0][0] += (X-_x) * (X-_x);
        A[0][1] += (X-_x) * (Y-_y);
        A[0][2] += (X-_x) * (Z-_z);

        A[1][0] += (Y-_y) * (X-_x);
        A[1][1] += (Y-_y) * (Y-_y);
        A[1][2] += (Y-_y) * (Z-_z);

        A[2][0] += (Z-_z) * (X-_x);
        A[2][1] += (Z-_z) * (Y-_y);
        A[2][2] += (Z-_z) * (Z-_z);
    }

    MatrixXd C(3,3);
    C <<A[0][0]/k, A[0][1]/k, A[0][2]/k,
        A[1][0]/k, A[1][1]/k, A[1][2]/k,
        A[2][0]/k, A[2][1]/k, A[2][2]/k;

    #pragma endregion

    EigenSolver<MatrixXd> es(C);
    MatrixXd Eval = es.eigenvalues().real().asDiagonal();
    MatrixXd Evec = es.eigenvectors().real();

    MatrixXd u,v,n;
    double a = Eval.row(0).col(0).value();
    double b = Eval.row(1).col(1).value();
    double c = Eval.row(2).col(2).value();

    #pragma region SET U V N

    if(a>b && a>c)
    {
        u = Evec.row(0);
        if(b>c) 
        { v = Eval.row(1); n = Eval.row(2);}
        else
        { v = Eval.row(2); n = Eval.row(1);}
    }
    else
    if(b>a && b>c)
    {
        u = Evec.row(1);
        if(a>c) 
        { v = Eval.row(0); n = Eval.row(2);}
        else
        { v = Eval.row(2); n = Eval.row(0);}
    }
    else
    {
        u = Eval.row(2);
        if(a>b) 
        { v = Eval.row(0); n = Eval.row(1);}
        else
        { v = Eval.row(1); n = Eval.row(0);}        
    }

    #pragma endregion

    MatrixXd O(3,3); 
    O <<u, 
        v, 
        n;

    MatrixXd UV(k,3);
    VectorXd N(k,1);

    for( int i=0; i<k; i++)
    {
        double x = dataPts[nnIdx[i]][0];;
        double y = dataPts[nnIdx[i]][1];;
        double z = dataPts[nnIdx[i]][2];;

        MatrixXd X(3,1);
        X << x-_x,
             y-_y,
             z-_z;

        MatrixXd T = O * X;

        double ui = T.row(0).col(0).value();
        double vi = T.row(1).col(0).value();
        double ni = T.row(2).col(0).value();

        UV.row(i) << ui * ui, ui * vi, vi * vi;
        N.row(i) << ni;
    }

    Vector3d S = UV.colPivHouseholderQr().solve(N);

    MatrixXd II(2,2);

    II << S.row(0).value(), S.row(1).value(),
          S.row(1).value(), S.row(2).value();

    EigenSolver<MatrixXd> es2(II);

    MatrixXd Eval2 = es2.eigenvalues().real().asDiagonal();
    MatrixXd Evec2 = es2.eigenvectors().real();

    double kmin, kmax;
    if(Eval2.row(0).col(0).value() < Eval2.row(1).col(1).value())
    {
        kmin = Eval2.row(0).col(0).value();
        kmax = Eval2.row(1).col(1).value();
    }
    else
    {
        kmax = Eval2.row(0).col(0).value();
        kmin = Eval2.row(1).col(1).value();         
    }

    double thresh = 0.0020078;

    if (kmin < thresh && kmax > thresh )
        cout    << x << " " << y << " " << z << " "
                << 255 << " " << 0 << " " << 0 
                << endl;
    else 
        cout    << x << " " << y << " " << z << " "
                << 255 << " " << 255 << " " << 255 
                << endl;                    
}

delete [] nnIdx;
delete [] dists;
delete kdTree;
annClose();
}

它是我论文项目的一部分。我需要使用 3D 点云数据来完成。我没有随身携带扫描仪。它是第 3 方公司的,他们只是为我提供 3D 点。我只需要处理这个 3D 点。

谢谢,
尼沙

@Tom - 谢谢。MeshLab 的 polkadot3d 着色器并不准确,但它让我大致了解了山脊和山谷的位置。我认为 ANN 库没有给我正确的邻居,这会导致错误的法线。但我不知道如何解决这个问题。由于这是论文的一部分,我和我的教授提出了这个算法来提取山脊和山谷。根据我的研究和其他论文,我读到这种方法确实适用于提取 rigeys 和 valleys。我只是在代码中没有正确理解它:(我很确定你建议的方法也可以,但我可能必须坚持我目前的算法,如果它根本不起作用应该能够说出原因不工作!但是,目前问题似乎出在我的代码上,而不是我使用的方法,或者我在这里遗漏了一些步骤。

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1 回答 1

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您是否考虑过将问题转化为图像分析问题?如果您通过将手指按到平坦表面来扫描数据,那么您可以将扫描转换为图像,其中灰度级由每个点的 z 深度(表面与点之间的距离)确定。然后,您可以通过 Gourad 着色绘制三角形。您可能可以通过创建一个 3D 凸包然后测量它的 z 距离来做类似的事情。

有了图像后,您可以轻松找到山脊和山谷。

于 2011-06-20T05:49:27.003 回答