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我正在尝试将 Reactome 数据库加载到我的 Neo4j 桌面中。

我从 Reactome 网站 ( https://reactome.org/dev/graph-database#GetStarted ) 下载了最新版本的数据库,我的 Neo4j 桌面版本是 1.3.4,而创建的数据库我使用的是 Neo4j 4.1。 1(也尝试了 4.1.0)。

之后,我提取了 tar.gz 文件并使用 Neo4j Desktop 中的终端使用以下命令恢复了我的数据库中的数据:

bin/neo4j-admin restore --from=/PATH/reactome.graphdb/graph.db --database=graph.db

并按下开始按钮。启动成功,所以我在 Neo4J 浏览器中打开了它——它带有通知:

数据库“neo4j”不可用。运行 :sysinfo 以获取更多信息。

我检查了 debug.log:问题应该出在 neo4j.conf 文件 debug.log 中禁用的升级选项中 - 屏幕截图

所以我取消了以下选项的注释: dbms.allow_upgrade=true

但是当我尝试使用“开始”按钮运行数据集时,我只收到通知:

数据库无法启动:数据库 [database-e25f8ba8-dea1-4e70-8944-024f73a2eeaf] 'v4.1.1' 退出,状态为 'KILLED'。检查日志

检查日志后,我发现: neo4j.log - printscreen

我现在真的很累。有谁知道如何处理这个问题?非常感谢!

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您可能希望将以下脚本与 reactome.graphdb.dump 文件一起使用:

bin/neo4j-admin load --from=/PATH/reactome.graphdb.dump --database=reactome --force
于 2021-09-25T14:21:29.090 回答