我有描述包含在 3D 细胞壁结构中的体积的数据，包括体素数据（细胞壁内 1，细胞壁外 0）和表面网格（3D 坐标和相关的三角剖分）。我所追求的只是细胞形状的全局轮廓。
所有单元格的中心都有一个空心区域（体素填充为 0，因为它位于单元格壁之外）。对于大多数细胞，它完全封闭在细胞壁内，因此网格和体素都形成了 3D 外壳。这很好，因为填充中心区域对我来说是微不足道的。然而，在某些情况下，有一个孔，因此内部开口有一个直接通往细胞外的“隧道”，如附图所示。我需要关闭它，因为我只想要整个细胞形状的轮廓。那么问题是我如何关闭这条隧道到里面呢？电池具有粗糙的表面，带有许多细小的凹面区域，尽管这种巨大的凹面区域一直延伸到电池中心是不可接受的。
我尝试过使用 alpha 形状算法，但我在 3D 中找到的所有示例都使用了 Delauney 三角剖分，这与我的数据效果不佳（我在这里使用了最佳答案中的代码：3D 中的 Alpha 形状）。如果与我自己的表面网格三角剖分一起使用，这可能是一个可能的解决方案吗？或者有没有更好的方法？本质上，3D凹壳算法是我所想的。我正在使用 Python。
非常感谢您的任何想法。