我想模拟一个按时间索引的受限系统。这涉及基于某些逻辑/关系进行交互的代理/节点网络。我想将节点放在网格上 2D 或 3D 没关系。我想在它们之间画出边缘，并在它们旁边画出文字。我想给出节点上标签的逻辑并给出状态指示。simjava 的风格： simjava
但更多地基于数学模拟而不是软件过程。绘图工具会很有用等。有什么好的建议吗？有很好的数据集可视化软件。Matlab 的 Simulink 在非离散事件上具有很多复杂性，并且不像卡通那样有利于测试原理而不是分析。除非我错了，Simulink 提供了这个
编辑：一个类似的问题询问关于动态图 堆栈溢出相关的问题，这个问题似乎没有任何具体的解决方案，除了定制的解决方案。
唔。不确定我是否在正确的轨道上，但你看过graphviz吗？它将渲染图形（包括使用各种不同算法的自动布局）。有来自各种语言的绑定，例如python 的pydot。如果您需要图形分析算法（例如最短路径），还有pygraphlib。
graphviz 有替代品，例如protovis / infovis。两者都基于 javascript，提供强制导向布局，并在浏览器中呈现。
抱歉，如果我误解了问题，希望对您有所帮助。
可能是MathGL（跨平台 GPL 绘图库）可以满足您的要求。图形可视化不是 MathGL 的主要目标。但是，它有一个图元（矩形、线条、标记、弯曲的文本等），可以制作图形。它还可以处理 3D 数据。它允许交互——它在选定的位置（在鼠标点击时）返回对象 ID。
如果您想要工具来实际进行模拟加即，也许netlogo：https ://ccl.northwestern.edu/netlogo/ 如果您只想可视化链接随时间变化，也许Gephi： http: //gephi.github.io/ 或ndtvR包：http ://cran.r-project.org/web/packages/ndtv/index.html