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我想在 R 中对正常和双对数图中的数据进行线性回归。

对于普通数据，数据集可能如下：

lin <- data.frame(x = c(0:6), y = c(0.3, 0.1, 0.9, 3.1, 5, 4.9, 6.2))
plot (lin$x, lin$y)

在那里，我想计算仅为数据点 2、3 和 4 的线性回归绘制一条线。

对于双对数数据，数据集可能如下：

data = data.frame(
    x=c(1:15),
    y=c(
        1.000, 0.742, 0.623, 0.550, 0.500, 0.462, 0.433,
        0.051, 0.043, 0.037, 0.032, 0.028, 0.025, 0.022, 0.020
      )
    )
plot (data$x, data$y, log="xy")

在这里，我想为数据集 1:7 和 8:15 绘制回归线。

我可以计算斜率和y 偏移量以及拟合参数（R^2，p 值）吗？

如何处理正常数据和对数数据？

谢谢你的帮助，

斯文

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在 R 中，通过函数拟合线性最小二乘模型lm()。使用公式接口我们可以使用subset参数来选择用于拟合实际模型的数据点，例如：

lin <- data.frame(x = c(0:6), y = c(0.3, 0.1, 0.9, 3.1, 5, 4.9, 6.2))
linm <- lm(y ~ x, data = lin, subset = 2:4)

给予：

R> linm

Call:
lm(formula = y ~ x, data = lin, subset = 2:4)

Coefficients:
(Intercept)            x  
     -1.633        1.500  

R> fitted(linm)
         2          3          4 
-0.1333333  1.3666667  2.8666667

至于双对数，我猜你有两个选择；i) 像我们上面所做的那样估计两个单独的模型，或 ii) 通过 ANCOVA 估计。对数转换在公式中使用log().

通过两个独立的模型：

logm1 <- lm(log(y) ~ log(x), data = dat, subset = 1:7)
logm2 <- lm(log(y) ~ log(x), data = dat, subset = 8:15)

或者通过 ANCOVA，我们需要一个指示变量

dat <- transform(dat, ind = factor(1:15 <= 7))
logm3 <- lm(log(y) ~ log(x) * ind, data = dat)

您可能会问这两种方法是否等效？好吧，我们可以通过模型系数来证明这一点。

R> coef(logm1)
  (Intercept)        log(x) 
-0.0001487042 -0.4305802355 
R> coef(logm2)
(Intercept)      log(x) 
  0.1428293  -1.4966954

因此，对于单独的模型，两个斜率分别为 -0.4306 和 -1.4967。ANCOVA 模型的系数为：

R> coef(logm3)
   (Intercept)         log(x)        indTRUE log(x):indTRUE 
     0.1428293     -1.4966954     -0.1429780      1.0661152

我们如何调和两者？好吧，我设置的方式ind是logm3参数化的，以提供更直接的估计值logm2；logm2和的截距logm3相同， 的系数也相同log(x)。为了得到与 的系数相等的值logm1，我们需要进行操作，首先是截距：

R> coefs[1] + coefs[3]
  (Intercept) 
-0.0001487042

其中系数为indTRUE第 1 组的平均值与第 2 组的平均值之差。对于斜率：

R> coefs[2] + coefs[4]
    log(x) 
-0.4305802

这与我们得到的相同，logm1并且基于第 2 组 ( ) 的coefs[2]斜率，由第 1 组 ( ) 的斜率差异修改coefs[4]。

至于绘图，一个简单的方法是通过abline()简单模型。例如对于普通数据示例：

plot(y ~ x, data = lin)
abline(linm)

对于日志数据，我们可能需要更有创意，这里的一般解决方案是预测数据范围并绘制预测：

pdat <- with(dat, data.frame(x = seq(from = head(x, 1), to = tail(x,1), 
                                     by = 0.1))
pdat <- transform(pdat, yhat = c(predict(logm1, pdat[1:70,, drop = FALSE]), 
                                 predict(logm2, pdat[71:141,, drop = FALSE])))

它可以通过取幂在原始比例上绘制yhat

plot(y ~ x, data = dat)
lines(exp(yhat) ~ x, dat = pdat, subset = 1:70, col = "red")
lines(exp(yhat) ~ x, dat = pdat, subset = 71:141, col = "blue")

或对数刻度：

plot(log(y) ~ log(x), data = dat)
lines(yhat ~ log(x), dat = pdat, subset = 1:70, col = "red")
lines(yhat ~ log(x), dat = pdat, subset = 71:141, col = "blue")

例如...

这种通用解决方案也适用于更复杂的 ANCOVA 模型。在这里我像以前一样创建一个新的 pdat 并添加一个指标

pdat <- with(dat, data.frame(x = seq(from = head(x, 1), to = tail(x,1), 
                                     by = 0.1)[1:140],
                             ind = factor(rep(c(TRUE, FALSE), each = 70))))
pdat <- transform(pdat, yhat = predict(logm3, pdat))

predict()请注意，由于使用 ANCOVA to fit ，我们如何从单个调用中获得我们想要的所有预测logm3。我们现在可以像以前一样绘制：

plot(y ~ x, data = dat)
lines(exp(yhat) ~ x, dat = pdat, subset = 1:70, col = "red")
lines(exp(yhat) ~ x, dat = pdat, subset = 71:141, col = "blue")
于 2011-06-08T11:07:22.330 回答
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#Split the data into two groups
data1 <- data[1:7, ]
data2 <- data[8:15, ]

#Perform the regression
model1 <- lm(log(y) ~ log(x), data1)
model2 <- lm(log(y) ~ log(x), data2)
summary(model1)
summary(model2)

#Plot it
with(data, plot(x, y, log="xy"))
lines(1:7, exp(predict(model1, data.frame(x = 1:7))))
lines(8:15, exp(predict(model2, data.frame(x = 8:15))))

一般来说，将数据分成不同的组并在不同的子集上运行不同的模型是不寻常的，而且可能是不好的形式。您可能需要考虑添加分组变量

data$group <- factor(rep(letters[1:2], times = 7:8))

并在整个数据集上运行某种模型，例如，

model_all <- lm(log(y) ~ log(x) * group, data)
summary(model_all)
于 2011-06-08T11:06:31.957 回答