我正在编写一个 sparql 查询来搜索以下内容rdfxml
<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<rdf:RDF xmlns:bqbiol="http://biomodels.net/biology-qualifiers/"
xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#">
<rdf:Description rdf:about="PhysicalEntity0001">
<bqbiol:is rdf:resource="https://identifiers.org/uniprot/PD12345"/>
<bqbiol:isPartOf rdf:resource="https://identifiers.org/fma/fma:1234"/>
</rdf:Description>
<rdf:Description rdf:about="SemsimMetaid0000">
<bqbiol:isPropertyOf rdf:resource="PhysicalEntity0001"/>
<bqbiol:isVersionOf rdf:resource="https://identifiers.org/opb/opb_1234"/>
</rdf:Description>
</rdf:RDF>
这个查询:
"SELECT ?subject ?predicate ?resource\n"
"WHERE { \n"
" ?subject ?predicate ?resource .\n"
"}";
按我的预期工作并产生:
subject,predicate,resource
SemsimMetaid0000,http://biomodels.net/biology-qualifiers/isPropertyOf,PhysicalEntity0000
PhysicalEntity0000,http://biomodels.net/biology-qualifiers/is,https://identifiers.org/uniprot/PD12345
PhysicalEntity0000,http://biomodels.net/biology-qualifiers/isPartOf,https://identifiers.org/fma/fma:1234
当格式化为csv
. 然而这:
"SELECT ?predicate ?resource\n"
"WHERE { \n"
" <SemsimMetaid0000> ?predicate ?resource .\n"
"}";
作为一个空的结果集出现。谁能告诉我为什么?
笔记:
- 我正在使用一个
C
调用rasqal
来执行查询的库,而 rdf 图是raptor
(如果这对你们中的任何人都意味着什么=]) - 所有节点都是 URI / IRI 节点,因此尝试
"SemsimMetaid0000"
也不起作用。 - 在搜索 rdf 图时没有基本 uri。序列化需要基本 uri,
rdfxml
但在搜索图形时,我还没有设置基本 uri。