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我正在尝试使用https://cran.r-project.org/web/packages/littler/vignettes/littler-examples.html#install2r:_With_Cmdline_Parsing安装一些我收到错误的软件包dependency 'graph' is not available。看来这个包可从 Bioconductor 项目（https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/graph.html）获得，但我不知道如何使用install2.r.

那么，具体来说，我该如何使用安装 bioconductor 包install2.r？

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你不能因为 BioConductor 使用不同的存储库结构。

installBioc.r但是因为这是一个足够频繁的问题，所以我最近添加了一个您使用的帮助脚本。要使用它，首先要做

 install.r littler BiocManager

以确保我们拥有当前littler版本以及BiocManager我们需要的 BioC 包。然后使用例如

  /usr/local/lib/R/site-library/littler/examples/installBioc.r S4Vectors

它将关闭并安装BiocVersion，S4Vectors以及依赖项BiocGenerics。

于 2020-06-18T17:33:46.767 回答