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我是 R 的初学者，试图在 R studio 中使用 velocyto.R 分析我的 scRNA-seq 数据。按照 velocyto 教程，我尝试安装 velocyto.R，如下所示：

library(devtools)
install_github("velocyto-team/velocyto.R")

但是，弹出一个错误：

ERROR: compilation failed for package 'velocyto.R'

removing 'C:/Users/USER/Documents/R/win-library/3.6/velocyto.R'
Error: Failed to install 'velocyto.R' from GitHub:
(converted from warning) installation of package ‘C:/Users/USER/AppData/Local/Temp/RtmpukpRFl/file37346a812b86/velocyto.R_0.6.tar.gz’ had non-zero exit status

有没有人面临上述同样的问题并最终成功解决？我迫切需要帮助！

谢谢

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正如您的错误日志所述C:/...，您可能使用的是 Windows。根据 velocyto 的自述文件，这个包似乎只在带有、、和库的unix 风格的系统上运行。C++11Open MPboostigraphhdf5c++

这可能是问题所在：阅读 velocyto 的 GitHub 问题#40，也许您需要在 WSL 下运行它...？

于 2020-06-08T07:39:38.400 回答