我正在研究环境参数是否会影响与森林中的山毛榉共生的根真菌的群落组成。因此,我正在执行一个 RDA,其中包含一个存在与否的社区数据集和一个环境数据集,其中包含连续的环境参数(pH、土壤湿度……)和一个分类参数“再生”,它有 4 个类别对应于发育阶段山毛榉(SNReg 和 SReg 是幼苗,RegLow 和 RegHigh 是树苗)。
在绘制包含我的所有参数的 RDA 时,随后在逐步选择之后,此分类参数被绘制为质心,而不是按预期绘制的箭头。然而,逐步选择揭示了经度是强烈推动群落组成变化的因素。因此,我想做一个部分 RDA 来看看环境参数的影响,校正了经度的影响。然而,现在分类参数“再生”被绘制为箭头而不是质心,而它被认为是一个因素。如果我调用 RDA 的摘要,则没有因子约束的质心,并且因子“再生”仅包含在约束变量的双标得分中。用虚拟变量替换也不能解决这个问题。
我发布了带有质心的 RDA 图的图像,以及没有质心的部分 RDA 图,其中再生被绘制为箭头。