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我的问题是Rmd在 RStudio 中运行一个完美地运行所有块,但是编织(到 html 文档)遇到一个模糊的错误。

为了进行调试,我sessionInfo()在常规 R 会话和Rmd加载相同包的 clean 中运行。

唯一的区别是 R 会话说

BLAS:   /System/Library/Frameworks/Accelerate.framework/Versions/A/Frameworks/vecLib.framework/Versions/A/libBLAS.dylib

Rmd输出sessionInfo()是:

BLAS:   /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/lib/libRblas.0.dylib

这可能是一个问题,还是 RStudio 中的 R 会话使用与 RMarkdown 不同的 BLAS 是否正常?

在了解 BLAS 时,我读到它是 call 的结果,extSoftVersion()["BLAS"]这里记录并说:

BLAS 的二进制/可执行文件的名称可以用来指示正在使用的实现。通常,BLAS 的 R 版本将显示为 libR.so (libR.dylib)、R 或 libRblas.so (libRblas.dylib),具体取决于 R 的构建方式。请注意,对于已由系统管理员复制、硬链接或重命名的外部 BLAS 实现,也可能会显示 libRblas.so (libRblas.dylib)。对于外部 BLAS,将给出一个共享对象文件,其路径/名称可能指示供应商/版本。检测在 Windows 上不起作用。

FWIW 我试图简单地将工作的 BLAS 移动到不工作的 BLAS 的位置(删除不工作的文件),但我得到了

dyld: Library not loaded: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.6/Resources/lib/libRblas.dylib
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/exec/R
  Reason: image not found
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