另一个阻碍计算边际效应effects::Effect()
(或ggpredict::ggeffect()
使用相同函数)的原因是数据中存在标记变量,即类的那些列haven_labelled
。使用库导入外部格式(例如,SPSS、Stata、SAS)的数据集时,此类变量很常见haven
。
在以下示例中,问题何时出现很清楚:
# Load libraries
library(ggeffects)
library(haven)
# Fit model with no labelled variables
ex1 <- lm(mpg ~ cyl,
data = mtcars)
ggeffect(ex1, term = c("cyl"))
#>
#> # Predicted values of mpg
#> # x = cyl
#>
#> x | Predicted | SE | 95% CI
#> -------------------------------------
#> 4 | 26.38 | 0.90 | [24.53, 28.23]
#> 6 | 20.63 | 0.57 | [19.47, 21.79]
#> 8 | 14.88 | 0.81 | [13.22, 16.54]
# Label one value of variable cyl
mtcars$cyl2 <- labelled(mtcars$cyl, labels = c("6" = 6))
# Fit model with the value-labelled variable cyl2
ex2 <- lm(mpg ~ cyl2,
data = mtcars)
ggeffect(ex2, term = c("cyl2"))
#> Can't compute marginal effects, 'effects::Effect()' returned an error.
#>
#> Reason: non-conformable arguments
#> You may try 'ggpredict()' or 'ggemmeans()'.
#> NULL
effects::Effect(ex2, "cyl2")
#> Error in eval(parse(text = x, keep.source = FALSE)[[1L]]): object 'cyl2' not found
要检查您的数据中是否有类型的列,haven_labelled
您可以使用str(data)
并将持有此类的人更改为相关的人。检查您的类的一种方法例如,您可以使用以下代码检查列的类:
library(haven)
mtcars$cyl2 <- labelled(mtcars$cyl, labels = c("6" = 6))
str(mtcars)
#> 'data.frame': 32 obs. of 12 variables:
#> $ mpg : num 21 21 22.8 21.4 18.7 18.1 14.3 24.4 22.8 19.2 ...
#> $ cyl : num 6 6 4 6 8 6 8 4 4 6 ...
#> $ disp: num 160 160 108 258 360 ...
#> $ hp : num 110 110 93 110 175 105 245 62 95 123 ...
#> $ drat: num 3.9 3.9 3.85 3.08 3.15 2.76 3.21 3.69 3.92 3.92 ...
#> $ wt : num 2.62 2.88 2.32 3.21 3.44 ...
#> $ qsec: num 16.5 17 18.6 19.4 17 ...
#> $ vs : num 0 0 1 1 0 1 0 1 1 1 ...
#> $ am : num 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 ...
#> $ gear: num 4 4 4 3 3 3 3 4 4 4 ...
#> $ carb: num 4 4 1 1 2 1 4 2 2 4 ...
#> $ cyl2: 'haven_labelled' num 6 6 4 6 8 6 8 4 4 6 ...
#> ..- attr(*, "labels")= Named num 6
#> .. ..- attr(*, "names")= chr "6"