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我已经安装了 python 包 pymatgen,当我在我的 Jupyter 笔记本中使用它时它可以完美地工作。但是,现在我想按照此处指定的方式进行 POSCAR 设置:https ://pymatgen.org/installation.html 但是当我pmg config -p <EXTRACTED_VASP_POTCAR> <MY_PSP>在命令行(Linux)中运行:(使用我的目录)时,它找不到它并且我得到错误:

Command 'pmg' not found, did you mean:

  command 'mg' from deb mg
  command 'pmc' from deb linuxptp
  command 'pig' from deb bsdgames
  command 'pmi' from deb powermanagement-interface
  command 'pmw' from deb pmw
  command 'vmg' from deb vmg
  command 'pms' from deb pms
  command 'pm' from deb powerman
  command 'peg' from deb peg

编辑:我找到了文件“pmg”,它看起来如下:

#!/home/ramfrey/anaconda3/bin/python

# -*- coding: utf-8 -*-
import re
import sys

from pymatgen.cli.pmg import main

if __name__ == '__main__':
    sys.argv[0] = re.sub(r'(-script\.pyw?|\.exe)?$', '', sys.argv[0])
    sys.exit(main())

如果我运行python pmg我会得到错误:

Traceback (most recent call last):
  File "pmg", line 7, in <module>
    from pymatgen.cli.pmg import main
ImportError: No module named pymatgen.cli.pmg

但是这个确切的模块“pymatgen.cli.pmg”我可以毫无问题地导入到我的jupyter笔记本中。而且我还是不太明白,因为在安装指南中,它说应该直接运行“pmg config…”

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1 回答 1

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问题确实是我使用了错误的python版本来运行pmg脚本(这是一台具有许多不同python版本的工作计算机,我使用的是python 3.7.6但是有一个旧的python 2.7设置为默认值当刚刚运行“python pmg”时)。我conda activate base在我的 /home/username/anaconda3 中运行,然后python pmg etc.它工作了。

于 2020-03-21T13:46:30.957 回答