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我正在使用 pandas 和 uproot 从 .root 文件中读取数据,我得到如下表:

在此处输入图像描述

上述表格由以下代码制成:

fname = 'ZZ4lAnalysis_VBFH.root' 
key = 'ZZTree/candTree'
ttree = uproot.open(fname)[key]
branches = ['Z1Flav', 'Z2Flav', 'nCleanedJetsPt30', 'LepPt', 'LepLepId'] 
df = ttree.pandas.df(branches, flatten=False)

我需要在 LepPt 中找到最大值,一旦找到最大值,我还需要检索该最大值的 LepLepId。我找到最大值没有问题:

Pt_l1 = [max(i) for i in df.LepPt]

通过这种方式,我得到了一个包含所有最大值的数组。但是,我必须根据 LepLepId 分隔这些值。所以我需要一个最大 LepPt 和 |LepLepId|=11 的数组和一个最大 LepPt 和 |LepLepId|=13 的数组。

如果有人能给我任何提示、建议和/或建议,我将不胜感激。

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您可以awkward.JaggedArray为此使用接口(的依赖项之一uproot),它允许您拥有不规则大小的数组。

为此,您需要稍微改变加载数据的方式,但它允许您使用与普通numpy数组相同的方法,即argmax

fname = 'ZZ4lAnalysis_VBFH.root' 
key = 'ZZTree/candTree'
ttree = uproot.open(fname)[key]
# branches = ['Z1Flav', 'Z2Flav', 'nCleanedJetsPt30', 'LepPt', 'LepLepId']
branches = ['LepPt', 'LepLepId']   # to save memory, only load what you need

# df = ttree.pandas.df(branches, flatten=False)
a = ttree.arrays(branches)    # use awkward array interface

max_pt_idx = a[b'LepPt'].argmax()
max_pt_lepton_id = a[b'LepLepld'][max_pt_idx].flatten()

这只是一个普通numpy数组,如果需要,您可以将其分配给数据框的列pandas。它应该具有正确的维度和顺序。它也应该比使用内置 Python 函数更快。

请注意,键是字节串,而不是普通字符串,如果有没有轻子的事件,您将不得不采取一些额外的步骤(在这种情况下,flatten将忽略那些空事件,破坏对齐)。

或者,您也可以在之后转换列:

import awkward

df = ttree.pandas.df(branches, flatten=False)

max_pt_idx = awkward.fromiter(df["LepPt"]).argmax()
lepton_id = awkward.fromiter(df["LepLepld"])
df["max_pt_lepton_id"] = lepton_id[max_pt_idx].flatten()

如果之后您不再需要这些列,前者会更快,否则后者可能会更好。

于 2020-02-27T11:37:45.087 回答
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我制作了一些模拟数据,因为您没有以任何简单的格式提供您的数据。我想这就是你要找的。

import pandas as pd

df = pd.DataFrame.from_records(
    [   [[1,2,3], [4,5,6]],
        [[4,6,5], [7,8,9]]
    ],
    columns=['LepPt', 'LepLepld']
)

df['max_LepPt'] = [max(i) for i in df.LepPt]

def f(row):
    # get index position within list
    pos = row['LepPt'].index(row['max_LepPt']).tolist()
    return row['LepLepld'][pos]

df['same_index_LepLepld'] = df.apply(lambda x: f(x), axis=1)

返回:

    LepPt       LepLepld    max_LepPt   same_index_LepLepld
0   [1, 2, 3]   [4, 5, 6]   3           6
1   [4, 6, 5]   [7, 8, 9]   6           8
于 2020-02-06T21:48:33.087 回答