我正在使用 samtools 删除重复项。要标记然后删除重复项，markdup 依赖于 fixmates 提供的 ms（伴侣分数）和 MC（伴侣雪茄）标签。
有谁知道这些标签到底是什么？固定伴侣的表现如何？
谢谢您的帮助！
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MC标签是 Mate CIGAR，whish 是其伴侣的 CIGAR。ms不是标准标签，但我认为它是其伴侣的分数。
您可以在规范中找到详细信息：https ://samtools.github.io/hts-specs/SAMtags.pdf
fixmates应该只是将数据从一个伴侣复制到另一个伴侣，反之亦然。
顺便说一句，这不是一个编程问题，所以这不是问这个问题的合适地方。最好尝试生物信息学。
于 2020-02-04T20:18:31.790 回答