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背景

我自学了机器学习,最近开始研究 Julia 机器学习生态系统。


来自 python 背景并具有一些 Tensorflow 和OpenCV /skimage经验,我想将 Julia ML 库(Flux/JuliaImages)与它的同行进行基准测试,看看它真正执行 CV(任何)任务的速度有多快或多慢,并决定是否我应该转向使用 Julia。

我知道如何使用timeit这样的模块在 python 中执行一个函数所花费的时间:

#Loading an Image using OpenCV

s = """\
img = cv2.imread('sample_image.png', 1)
"""
setup = """\
import timeit
"""
print(str(round((timeit.timeit(stmt = s, setup = setup, number = 1))*1000, 2)) + " ms")
#printing the time taken in ms rounded to 2 digits

如何使用适当的库(在本例中为JuliaImages)比较在 Julia 中执行相同任务的函数的执行时间。

Julia 是否为 time/benchmark 提供任何函数/宏?

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using BenchmarkTools是对 Julia 函数进行基准测试的推荐方法。除非您正在计时一些需要很长时间的事情,否则请使用其中一个或从它导出@benchmark的不太冗长的宏。@btime因为这些宏背后的机制多次评估目标函数,@time所以对于运行缓慢的事物(例如涉及磁盘访问或非常耗时的计算)进行基准测试很有用。

@btime使用或正确使用很重要@benchmark,这样可以避免误导性结果。通常,您正在对一个接受一个或多个参数的函数进行基准测试。基准测试时,所有参数都应该是外部变量:(没有基准宏)

x = 1
f(x)
# do not use f(1)

该函数将被多次评估。为了防止在每次评估函数时重新评估函数参数,我们必须通过在$用作参数的每个变量的名称前加上前缀 a 来标记每个参数。基准测试宏使用它来指示应该在基准测试过程开始时评估(解析)一次变量,然后直接重用结果:

julia> using BenchmarkTools
julia> a = 1/2;
julia> b = 1/4;
julia> c = 1/8;
julia> a, b, c
(0.5, 0.25, 0.125)

julia> function sum_cosines(x, y, z)
         return cos(x) + cos(y) + cos(z)
       end;

julia> @btime sum_cosines($a, $b, $c);  # the `;` suppresses printing the returned value
  11.899 ns (0 allocations: 0 bytes)    # calling the function takes ~12 ns (nanoseconds)
                                        # the function does not allocate any memory
# if we omit the '$', what we see is misleading
julia> @btime sum_cosines(a, b, c);    # the function appears more than twice slower 
 28.441 ns (1 allocation: 16 bytes)    # the function appears to be allocating memory
# @benchmark can be used the same way that @btime is used
julia> @benchmark sum_cosines($a,$b,$c) # do not use a ';' here
BenchmarkTools.Trial:
  memory estimate:  0 bytes
  allocs estimate:  0
  --------------
  minimum time:     12.111 ns (0.00% GC)
  median time:      12.213 ns (0.00% GC)
  mean time:        12.500 ns (0.00% GC)
  maximum time:     39.741 ns (0.00% GC)
  --------------
  samples:          1500
  evals/sample:     999

虽然有一些参数可以调整,但默认值通常效果很好。有关面向经验丰富的用户的 BenchmarkTools 的更多信息,请参阅手册

于 2020-01-20T19:41:03.123 回答
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Julia 提供了两个用于计时/基准测试代码运行时的宏。这些是 :

  • @时间
  • @benchmark:外部,安装Pkg.add("BenchmarkTools")

使用 BenchmarkTools 的 @benchmark 非常简单,有助于您比较两种语言的速度。@benchark针对您提供的 python bench使用的示例。

using Images, FileIO, BenchmarkTools

@benchmark img = load("sample_image.png")

输出 :

BenchmarkTools.Trial: 
  memory estimate:  3.39 MiB
  allocs estimate:  322
  --------------
  minimum time:     76.631 ms (0.00% GC)
  median time:      105.579 ms (0.00% GC)
  mean time:        110.319 ms (0.41% GC)
  maximum time:     209.470 ms (0.00% GC)
  --------------
  samples:          46
  evals/sample:     1

现在要比较平均时间,您应该将samples(46) 作为 Python timeit 代码中的数字,然后将其除以相同的数字以获得平均执行时间。

print(str(round((timeit.timeit(stmt = s, setup = setup, number = 46)/46)*1000, 2)) + " ms")

您可以按照此过程对 Julia 和 Python 中的任何函数进行基准测试。我希望你的疑虑已经消除。


注意从统计的角度来看,@benchmark 比@time 好得多。

于 2020-01-20T17:21:49.920 回答