尝试在 R 中绘制网络图。如何使用 IGraph 延长网络图中的边？
我实际上想使用 fruchterman-reingold 布局。有什么方法可以使基于力的算法“更有弹性”，以便我的顶点相距更远？
谢谢。
问问题
11030 次
2 回答
16
layout.fruchterman.reingold您可以使用该函数控制 Fruchterman-Reingold 算法。见：help('layout.fruchterman.reingold')。我经常使用并让您获得更多间距的设置是：
l <- layout.fruchterman.reingold(g,niter=500,area=vcount(g)^2.3,repulserad=vcount(g)^2.8)
plot(g,layout=l)
g您的图形对象在哪里。最好只为您的图表测试这些参数的不同值，看看有什么效果。尤其repulserad影响图表中的间距。默认值是节点数的平方，因此更高的值应该得到更多间隔的图形。
于 2011-05-11T19:02:06.363 回答
7
如果layout.fruchterman.reingold算法仍然不能通过调整参数给出你想要的，只需执行以下操作。每个布局都返回一组坐标，x 和 y 坐标分别位于第一列和第二列。您可以在此处应用您喜欢的任何转换，如果您只想扩展它，只需使用
L = layout.fruchterman.reingold(G)*s; #Scaling factor s
当然也可以进行更多花哨的转换。只是为了记录，您还可以使用鼠标手动编辑布局tkplot(G, layout=L)。您可以通过 获取坐标L = tkplot.getcoords(1)。
于 2011-05-24T09:09:14.490 回答