r - 删除具有 nan 值的行

Question

比方说，例如，我有这个数据：

data <- c(1,2,3,4,5,6,NaN,5,9,NaN,23,9)
attr(data,"dim") <- c(6,2)
data

     [,1] [,2]
[1,]    1  NaN
[2,]    2    5
[3,]    3    9
[4,]    4  NaN
[5,]    5   23
[6,]    6    9

现在我想删除其中包含 NaN 值的行：第 1 行和第 4 行。但我不知道这些行在哪里，如果它是 100.000+ 行的数据集，所以我需要用函数找到它们并删除完整的行。

谁能指出我正确的方向？

Answer 1

该函数complete.cases将告诉您需要的行在哪里：

data <- matrix(c(1,2,3,4,5,6,NaN,5,9,NaN,23,9), ncol=2)
data[complete.cases(data), ]

     [,1] [,2]
[1,]    2    5
[2,]    3    9
[3,]    5   23
[4,]    6    9

Answer 2

数据

data <- matrix(rnorm(100000000), ncol=10000)
idx <- sample(1:10000,100)
idy <- sample(1:10000,100)
data[idx,idy] <- NaN

功能

foo <- function(d=data) d[apply(d,2,function(x) any(is.nan(x))),]

运行时间

> system.time(data[complete.cases(data),])
   user  system elapsed 
   3.53    0.12    3.65 

> system.time(foo(data))
   user  system elapsed 
   2.37    0.09    2.46