我运行了顺序特征选择 (mlxtend) 以找到在 KNN 中使用的最佳(通过 roc_auc 评分)特征。然而,当我选择最好的特征并使用相同的参数通过 sklearn knn 运行它们时,我得到一个非常不同的 roc_auc 值(0.83 对 0.67)。
通读 mlxtend 文档,它使用 sklearn roc_auc 评分,所以我无法弄清楚为什么我会得到如此不同的分数。
扩展
knn = KNeighborsClassifier(n_neighbors=4)
from mlxtend.feature_selection import SequentialFeatureSelector as SFS
sfs1 = SFS(knn,
k_features=5,
forward=True,
floating=True,
verbose=2,
scoring='roc_auc',
cv=5)
sfs1 = sfs1.fit(X, y)
Sklearn 我从一个 sklearn 示例中获取了这个——https: //scikit-learn.org/stable/auto_examples/model_selection/plot_roc_crossval.html
##KNN
cv = StratifiedKFold(n_splits=5,shuffle=False)
classifier = KNeighborsClassifier(n_neighbors=4,weights='uniform')
tprs = []
aucs = []
mean_fpr = np.linspace(0, 1, 100)
i = 0
for train, test in cv.split(X, y):
probas_ = classifier.fit(X[train], y[train]).predict_proba(X[test])
# Compute ROC curve and area the curve
fpr, tpr, thresholds = roc_curve(y[test], probas_[:, 1])
tprs.append(interp(mean_fpr, fpr, tpr))
tprs[-1][0] = 0.0
roc_auc = auc(fpr, tpr)
aucs.append(roc_auc)
plt.plot(fpr, tpr, lw=1, alpha=0.3,
label='ROC fold %d (AUC = %0.2f)' % (i, roc_auc))
i += 1
plt.plot([0, 1], [0, 1], linestyle='--', lw=2, color='r',
label='Chance', alpha=.8)
mean_tpr = np.mean(tprs, axis=0)
mean_tpr[-1] = 1.0
mean_auc = auc(mean_fpr, mean_tpr)
std_auc = np.std(aucs)
plt.plot(mean_fpr, mean_tpr, color='b',
label=r'Mean ROC (AUC = %0.2f $\pm$ %0.2f)' % (mean_auc, std_auc),
lw=2, alpha=.8)
std_tpr = np.std(tprs, axis=0)
tprs_upper = np.minimum(mean_tpr + std_tpr, 1)
tprs_lower = np.maximum(mean_tpr - std_tpr, 0)
plt.fill_between(mean_fpr, tprs_lower, tprs_upper, color='grey', alpha=.2,
label=r'$\pm$ 1 std. dev.')
plt.xlim([-0.05, 1.05])
plt.ylim([-0.05, 1.05])
plt.xlabel('False Positive Rate')
plt.ylabel('True Positive Rate')
plt.title('KNN ROC')
plt.legend(loc="lower right")
plt.show()
操作系统:10.14.6
Python:3.6.8.final.0
斯克学习:0.21.3
mlxtend:0.17.0