我经常遇到一个问题,即 Dask 在几个任务上随机停止,通常与从我的网络上的不同节点读取数据有关(下面有更多详细信息)。这可能在运行脚本几个小时后没有问题发生。它将以如下所示的形式无限期挂起(否则此循环需要几秒钟才能完成):
在这种情况下,我看到只有少数停滞的进程,并且都在一个特定的节点(192.168.0.228)上:
该节点上的每个工作人员都在几个 read_parquet 任务上停滞不前:
这是使用以下代码调用的,并且使用的是 fastparquet:
ddf = dd.read_parquet(file_path, columns=['col1', 'col2'], index=False, gather_statistics=False)
我的集群正在运行 Ubuntu 19.04 和 Dask 和 Distributed 的所有最新版本(截至 11/12)以及所需的软件包(例如,tornado、fsspec、fastparquet 等)
.228 节点尝试访问的数据位于我集群中的另一个节点上。.228 节点通过 CIFS 文件共享访问数据。我在运行脚本的同一节点上运行 Dask 调度程序(不同于 .228 节点和数据存储节点)。该脚本使用 Paramiko 通过 SSH 将工作人员连接到调度程序:
ssh_client = paramiko.SSHClient()
stdin, stdout, stderr = ssh_client.exec_command('sudo dask-worker ' +
' --name ' + comp_name_decode +
' --nprocs ' + str(nproc_int) +
' --nthreads 10 ' +
self.dask_scheduler_ip, get_pty=True)
.228 节点与调度程序和数据存储节点的连接看起来都很健康。.228 节点可能会在尝试处理 read_parquet 任务时遇到某种短暂的连接问题,但如果发生这种情况,那么 .228 节点与调度程序和 CIFS 共享的连接在该短暂时刻之后不会受到影响。在任何情况下,日志都不会显示任何问题。这是来自 .228 节点的整个日志:
distributed.worker - INFO - Start worker at: tcp://192.168.0.228:42445
distributed.worker - INFO - Listening to: tcp://192.168.0.228:42445
distributed.worker - INFO - dashboard at: 192.168.0.228:37751
distributed.worker - INFO - Waiting to connect to: tcp://192.168.0.167:8786
distributed.worker - INFO - -------------------------------------------------
distributed.worker - INFO - Threads: 2
distributed.worker - INFO - Memory: 14.53 GB
distributed.worker - INFO - Local Directory: /home/dan/worker-50_838ig
distributed.worker - INFO - -------------------------------------------------
distributed.worker - INFO - Registered to: tcp://192.168.0.167:8786
distributed.worker - INFO - -------------------------------------------------
撇开这是否是 Dask 或我的代码/网络中的错误不谈,是否可以为调度程序处理的所有任务设置一般超时?或者,是否可以:
- 识别停滞的任务,
- 复制一个停滞的任务并将其移动到另一个工人,并且
- 取消停滞的任务?