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我希望能够从日志中获取所有统计信息，以便将其用于图形表示。就目前而言，我的日志仅包含代数和评估数。该算法正在计算和输出 avg、std、min 和 max，但它们没有被返回，所以我不能使用它们。有没有办法从我的算法中获取这些值？

我曾尝试查看创建记录的文档，但其中的内容对我来说没有意义，或者与我的情况有关。

def main():
    pop = toolbox.population(n=300)
    hof = tools.HallOfFame(1)

    stats_fit = tools.Statistics(lambda ind: ind.fitness.values)
    stats_size = tools.Statistics(len)
    mstats = tools.MultiStatistics(fitness=stats_fit, size=stats_size)

    # my hope is that the values calculated by these functions show up in my logbook
    mstats.register("avg", numpy.mean)
    mstats.register("std", numpy.std)
    mstats.register("min", numpy.min)
    mstats.register("max", numpy.max)

    pop, log = algorithms.eaSimple(pop, toolbox, 0.5, 0.1, 200, stats=mstats,
                                   halloffame=hof, verbose=True)

    print(str(log[0]))  # only outputs generations, number of evaluations

我的输出看起来像这样（注意我从算法中排除了与树的大小有关的输出，因为我认为没有必要并且使输出混乱，但它确实输出了该数据）

gen nevals  avg     gen max     min     
0   300     1125.92 0   45318.7 83.1079
1   173     1031.65 1   33883.4 83.1079
2   163     779.317 2   1888.68 83.1079
3   149     901.061 3   33606.2 82.4655
4   165     686.407 4   33883.4 81.8855
5   177     962.785 5   33757   81.8855
6   184     1632.86 6   33885.7 81.8855
7   171     1509.72 7   33856.9 81.8855
8   182     984.048 8   33732.6 81.6701
9   177     1534.63 9   34009.9 81.3255
10  159     1277.39 10  33885.7 80.9722 
{'gen': 0, 'nevals': 300}

我希望最后一行应该包括日志中的所有其他内容

编辑：

深入挖掘我发现这可能是一个错误。该文档说，当此处包含统计信息时应该记录它https://deap.readthedocs.io/en/master/api/algo.html

它显示“它返回优化的种群和带有进化统计数据的日志。日志将包含世代数、每一代的评估数量以及统计数据（如果将统计数据作为参数给出）。”

我已经包含了统计数据，但它似乎不起作用。

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2 回答 2

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我发现了这个问题，这似乎是由我使用 MultiStatistics 引起的。我回到了正常的统计，它工作得很好

def main():
    pop = toolbox.population(n=300)
    hof = tools.HallOfFame(1)

    stats = tools.Statistics(lambda ind: ind.fitness.values)
    stats.register("avg", numpy.mean)
    stats.register("std", numpy.std)
    stats.register("min", numpy.min)
    stats.register("max", numpy.max)

    pop, log = algorithms.eaSimple(pop, toolbox, 0.5, 0.1, 40, stats,
                                   halloffame=hof, verbose=True)
    print(str(log[0]))
于 2019-11-03T15:00:57.057 回答
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当您使用多个统计数据时，您必须指定要访问的日志的章节。在您的示例中，统计信息有两章：fitness和size。因此，您示例中的最后一行应该是

print(log.chapters['fitness'][0])
print(log.chapters['size'][0])

这将输出

{'avg': 0.5061951303359752,
 'std': 0.12547520913281693,
 'min': 0.15187521062437034,
 'max': 0.9576681760851814,
 'gen': 0,
 'nevals': 300}
{'avg': 5.0, 'std': 0.0, 'min': 5, 'max': 5, 'gen': 0, 'nevals': 300}
于 2019-11-05T16:29:09.437 回答