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我有一个椭球的一般公式:

A*x**2 + C*y**2 + D*x + E*y + B*x*y + F + G*z**2 = 0

其中 A,B,C,D,E,F,G 是常数因子。

如何在 matplotlib 中将此方程绘制为 3D 图?(最好是线框。)

我看到了这个例子,但它是参数形式的,我不确定如何将 z 坐标放在这段代码中。有没有办法在没有参数形式的情况下保持一般形式来绘制这个?

我开始把它放在这样的代码中:

from mpl_toolkits import mplot3d
%matplotlib notebook
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

def f(x, y):
    return ((A*x**2 + C*y**2 + D*x + E*y + B*x*y + F))

def f(z):
    return G*z**2

x = np.linspace(-2200, 1850, 30)
y = np.linspace(-100, 60, 30)
z = np.linspace(-100, 60, 30)

X, Y, Z = np.meshgrid(x, y, z)

fig = plt.figure()
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
ax.plot_wireframe(X, Y, Z, rstride=10, cstride=10)
ax.set_xlabel('x')
ax.set_ylabel('y')
ax.set_zlabel('z');

我收到了这个错误:

---------------------------------------------------------------------------
ValueError                                Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-95b1296ae6a4> in <module>()
     18 fig = plt.figure()
     19 ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')
---> 20 ax.plot_wireframe(X, Y, Z, rstride=10, cstride=10)
     21 ax.set_xlabel('x')
     22 ax.set_ylabel('y')

C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio\Shared\Anaconda3_64\lib\site-packages\mpl_toolkits\mplot3d\axes3d.py in plot_wireframe(self, X, Y, Z, *args, **kwargs)
   1847         had_data = self.has_data()
   1848         if Z.ndim != 2:
-> 1849             raise ValueError("Argument Z must be 2-dimensional.")
   1850         # FIXME: Support masked arrays
   1851         X, Y, Z = np.broadcast_arrays(X, Y, Z)

ValueError: Argument Z must be 2-dimensional.
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旁注,但你所拥有的并不是 3d 椭球的最一般方程。你的方程可以改写为

A*x**2 + C*y**2 + D*x + E*y + B*x*y = - G*z**2 - F,

这意味着实际上对于每个值,z您都会获得不同级别的 2d 椭圆,并且切片相对于z = 0平面是对称的。这显示了您的椭圆体是如何不通用的,它有助于检查结果以确保我们得到的结果是有意义的。

假设我们采取一般观点r0 = [x0, y0, z0],你有

r0 @ M @ r0 + b0 @ r0 + c0 == 0

在哪里

M = [ A    B/2    0
     B/2    C     0
      0     0     G],
b0 = [D, E, 0],
c0 = F

其中@代表矩阵向量或向量向量乘积

您可以使用您的函数并绘制它的 isosurface,但这将是次优的:您需要为您的函数进行网格近似,这对于足够的分辨率来说非常昂贵,并且您必须明智地选择此采样的域。

相反,您可以对数据执行主轴转换,以概括您自己链接的规范椭圆体的参数图。

第一步是对角化MM = V @ D @ V.T,其中D对角线。因为它是一个实对称矩阵,所以这总是可能的并且V正交的。然后我们有

r0 @ V @ D @ V.T @ r0 + b0 @ r0 + c0 == 0

我们可以重新组合为

(V.T @ r0) @ D @ (V.T @ r0) + b0 @ V @ (V.T @ r0) + c0 == 0

这激发了辅助坐标r1 = V.T @ r0和向量的定义b1 = b0 @ V,我们得到

r1 @ D @ r1 + b1 @ r1 + c0 == 0.

由于D是一个对称矩阵,其特征值d1, d2, d3在其对角线上,所以上面是方程

d1 * x1**2 + d2 * x2**2 + d3 * x3**3 + b11 * x1 + b12 * x2 + b13 * x3 + c0 == 0

哪里r1 = [x1, x2, x3]b1 = [b11, b12, b13]

剩下的就是从 切换r1r2删除线性项:

d1 * (x1 + b11/(2*d1))**2 + d2 * (x2 + b12/(2*d2))**2 + d3 * (x3 + b13/(2*d3))**2 - b11**2/(4*d1) - b12**2/(4*d2) - b13**2/(4*d3) + c0 == 0

所以我们定义

r2 = [x2, y2, z2]
x2 = x1 + b11/(2*d1)
y2 = y1 + b12/(2*d2)
z2 = z1 + b13/(2*d3)
c2 = b11**2/(4*d1) b12**2/(4*d2) b13**2/(4*d3) - c0.

对于这些,我们终于有了

d1 * x2**2 + d2 * y2**2 + d3 * z2**2 == c2,
d1/c2 * x2**2 + d2/c2 * y2**2 + d3/c2 * z2**2 == 1

这是二阶曲面的规范形式。为了使它有意义地对应于一个椭球,我们必须确保、d1和都是严格正的。如果这得到保证,那么规范形式的半长轴是和。d2d3c2sqrt(c2/d1)sqrt(c2/d2)sqrt(c2/d3)

所以这就是我们要做的:

  1. 确保参数对应于椭球体
  2. 为极角和方位角生成 theta 和 phi 网格
  3. 计算变换后的坐标[x2, y2, z2]
  4. 将它们移回 (by r2 - r1) 以获得[x1, y1, z1]
  5. 将坐标转换回来,V得到我们感兴趣r0的实际坐标。[x, y, z]

这是我如何实现的:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from mpl_toolkits.mplot3d import Axes3D

def get_transforms(A, B, C, D, E, F, G): 
    """ Get transformation matrix and shift for a 3d ellipsoid 

    Assume A*x**2 + C*y**2 + D*x + E*y + B*x*y + F + G*z**2 = 0, 
    use principal axis transformation and verify that the inputs 
    correspond to an ellipsoid. 

    Returns: (d, V, s) tuple of arrays 
        d: shape (3,) of semi-major axes in the canonical form 
           (X/d1)**2 + (Y/d2)**2 + (Z/d3)**2 = 1 
        V: shape (3,3) of the eigensystem 
        s: shape (3,) shift from the linear terms 
    """ 

    # construct original matrix 
    M = np.array([[A, B/2, 0], 
                  [B/2, C, 0], 
                  [0, 0, G]]) 
    # construct original linear coefficient vector 
    b0 = np.array([D, E, 0]) 
    # constant term 
    c0 = F 

    # compute eigensystem 
    D, V = np.linalg.eig(M) 
    if (D <= 0).any(): 
        raise ValueError("Parameter matrix is not positive definite!") 

    # transform the shift 
    b1 = b0 @ V 

    # compute the final shift vector 
    s = b1 / (2 * D) 

    # compute the final constant term, also has to be positive 
    c2 = (b1**2 / (4 * D)).sum() - c0 
    if c2 <= 0: 
        print(b1, D, c0, c2) 
        raise ValueError("Constant in the canonical form is not positive!")

    # compute the semi-major axes 
    d = np.sqrt(c2 / D) 

    return d, V, s 

def get_ellipsoid_coordinates(A, B, C, D, E, F, G, n_theta=20, n_phi=40): 
    """Compute coordinates of an ellipsoid on an ellipsoidal grid 

    Returns: x, y, z arrays of shape (n_theta, n_phi) 
    """ 

    # get canonical grid 
    theta,phi = np.mgrid[0:np.pi:n_theta*1j, 0:2*np.pi:n_phi*1j] 
    r2 = np.array([np.sin(theta) * np.cos(phi), 
                   np.sin(theta) * np.sin(phi), 
                   np.cos(theta)]) # shape (3, n_theta, n_phi) 

    # get transformation data 
    d, V, s = get_transforms(A, B, C, D, E, F, G)  # could be *args I guess 

    # shift and transform back the coordinates 
    r1 = d[:,None,None]*r2 - s[:,None,None]  # broadcast along first of three axes
    r0 = (V @ r1.reshape(3, -1)).reshape(r1.shape)  # shape (3, n_theta, n_phi) 

    return r0  # unpackable to x, y, z of shape (n_theta, n_phi)

这是一个带有椭圆体的示例并证明它有效:

A,B,C,D,E,F,G = args = 2, -1, 2, 3, -4, -3, 4 
x,y,z = get_ellipsoid_coordinates(*args) 
print(np.allclose(A*x**2 + C*y**2 + D*x + E*y + B*x*y + F + G*z**2, 0))  # True

从这里开始的实际绘图是微不足道的。使用此答案中的 3d 缩放技巧来保留相等的轴:

# create 3d axes
fig = plt.figure() 
ax = fig.add_subplot(111, projection='3d')

# plot the data
ax.plot_wireframe(x, y, z)
ax.set_xlabel('x')
ax.set_ylabel('y')
ax.set_zlabel('z')

# scaling hack
bbox_min = np.min([x, y, z])
bbox_max = np.max([x, y, z])
ax.auto_scale_xyz([bbox_min, bbox_max], [bbox_min, bbox_max], [bbox_min, bbox_max])

plt.show()

结果如下所示: 绕 z 轴展平并旋转的椭圆体的图形

围绕它旋转很明显,表面确实相对于z = 0平面反射对称,这从方程中可以看出。

您可以更改函数的n_thetan_phi关键字参数以生成具有不同网格的网格。有趣的是,您可以将位于单位球体上的任何r2散点插入到函数中的定义中get_ellipsoid_coordinates(只要该数组的第一维大小为 3),输出坐标将具有相同的形状,但它们将被转换到实际的椭球体上。

您还可以使用其他库来可视化曲面,例如 mayavi,您可以在其中绘制我们刚刚计算的曲面,或者将其与内置的等值面进行比较。

于 2019-10-31T22:59:31.507 回答