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你好?谁能帮助 Azure DataBrick 上的 Hail 0.2?

在 pip install 之后出现了很多问题......

找不到 Java 包,导入 hail.plot , hl.init()

根据文件

https://docs.azuredatabricks.net/applications/genomics/tertiary/hail.html#create-a-hail-cluster

我已经 pip install hail

在集群环境设置中设置 ENABLE_HAIL=true

然而

import hail as hl
hl.init(sc, idempotent=True)

AttributeError: module 'hail' has no attribute 'init'

还有另一个文件

https://docs.azuredatabricks.net/applications/genomics/tertiary/hail.html

import hail as hl
import hail.expr.aggregators as agg
hl.init(sc, idempotent=True)

ModuleNotFoundError: No module named 'hail.expr'

任何人都可以提供解决方案吗?非常感谢 !!!

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2 回答 2

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您可能希望迁移到 Azure HDInsight,并按照下一页Microsoft Azure部分下的说明进行操作:

https://hail.is/docs/0.2/cloud/other_cloud_providers.html

这应该让你启动并运行!

于 2020-06-30T14:24:35.493 回答
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您在使用基因组学运行时吗?请参阅https://docs.microsoft.com/en-us/azure/databricks/runtime/genomicsruntime#dbr-genomics以使用基因组运行时启动集群。ENABLE_HAIL=true如果您设置了环境变量,那么将安装 Hail 。

于 2020-04-10T17:47:34.883 回答