fiji - 用斐济拼接数千个 .png 文件

Question

我编写了一个 Node.js 应用程序来创建我想要拼接的图像。我想创建一张包含 10,000 多个图表的图像。我最初的解决方案是创建每个包含 200 多个图表的图像，然后将它们拼接在一起。这导致 50 幅图像被缝合。

我现在希望为每张图片创建一个图表，生成超过 10,000 张图片，然后将它们拼接在一起。当我将文件拖放到斐济以创建蒙太奇时，它会打开每个单独的文件。打开整个收藏需要很长时间。

有没有一种方法可以创建包含数千张图像的蒙太奇并将所有内容拼接到斐济的单个文件中，而不需要打开每个图像？

Answer 1

你说你想拼接你的图像，这意味着你的目标是找到这些图像从特定通道覆盖的位置，但是当你说蒙太奇时，它看起来就像你真正想要做的是将图像连接成一个堆栈或将它们排列成蒙太奇。对我来说，您似乎有一个程序将输出某种形式的堆栈，该堆栈具有 200 个平面，然后将它们连接在一起或将它们对齐为蒙太奇。

原则上，您必须打开每张图像，但在批处理模式下打开它们并通过宏运行操作将通过不渲染可视图像来减少时间。不打开图像就无法在图像上运行 ImageJ/FIJI 操作，因为这超出了重命名或删除文件之类的范围。

如果您真的想拼接它们，请使用拼接插件功能进行网格/集合拼接，并将重叠设置为零。这需要将您的图像放在一个文件夹中，并在您的情况下将它们分成单独的图像而不是 200 个图像集，每个文件都标有递增的数字（即 file_name_1.tif、file_name_2.tif，其中每个 file_name 是相同的并且只有数字改变）。如果您有 200 个堆栈并且乐于将它们保留在创建的蒙太奇中，则文件命名约定需要相同。您应该选择 Fuse and Display 选项来获得结果图像。输出将是合并后的更大图像。

当您尝试以某种方式拼接图像并覆盖堆栈时，编写命令以批处理模式运行它也可以工作。

Answer 2

对于拼接，我强烈推荐 MIST 插件。对于批量打开文件，请尝试拖放包含图像的文件夹而不是图像本身。或者，通过文件 -> 导入 -> 图像序列。