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我是 ImageJ 的新手，但正在尝试了解有关编写宏的更多信息。

我有以“10Xred.tif”、“10Xgreen.tif”、“10Xblue”和“10Xlr.tif”结尾的图像。我想使用不同的参数处理每种颜色。

我编写的代码仅将所有文件从输入文件夹传输到输出文件夹，而不对其进行处理。我不确定问题出在哪里。

如果这个问题可能很乏味或不适合论坛目的，我深表歉意 - 非常感谢任何和所有建议！

谢谢你。

input = getDirectory("Input directory");
output = getDirectory("Output directory");

Dialog.create("File type");
Dialog.addString("File suffix: ", ".tif", 5);
Dialog.show();
suffix = Dialog.getString();

processFolder(input);

function processFolder(input) {
    list = getFileList(input);
    for (i = 0; i < list.length; i++) {
        if(File.isDirectory(list[i]))
            processFolder("" + input + list[i]);
        if(endsWith(list[i], suffix))
            processFile(input, output, list[i]);
    }
}


function processFile(input, output, file) {

title = (File.getName(input));    
        if (indexOf(title, "10Xblue") >= 0) {
            run("Channels Tool...");
            run("Blue");
            run("Subtract Background...", "rolling=50");
            run("Multiply...", "value=1.2");
            run("Set Scale...", "distance=1 known=0.65 pixel=1 unit=µm global");
            run("Scale Bar...", "width=100 height=5 font=18 color=White background=None location=[Lower Right] bold overlay");
            run("RGB Color");
            run("Flatten"); }
        else if (indexOf(title, "10Xred") >= 0) {
            run("Channels Tool...");
            run("Red");
            run("Subtract Background...", "rolling=50");
            run("Multiply...", "value=1.350");
            run("Scale Bar...", "width=100 height=5 font=18 color=White background=None location=[Lower Right] bold overlay");
            run("RGB Color");
            run("Flatten");}
        else if (indexOf(title, "10Xgreen") >= 0) {
            run("Channels Tool...");
            run("Green");
            run("Subtract Background...", "rolling=50");
            run("Multiply...", "value=1.250");
            run("Scale Bar...", "width=100 height=5 font=18 color=White background=None location=[Lower Right] bold overlay");
            run("RGB Color");
            run("Flatten"); }
        else if (indexOf(title, "10Xlr") >= 0) {
            run("Channels Tool...");
            run("Magenta");
            run("Subtract Background...", "rolling=50");
            run("Multiply...", "value=1.200");
            run("Scale Bar...", "width=100 height=5 font=18 color=White background=None location=[Lower Right] bold overlay");
            run("RGB Color");
            run("Flatten");
        }


    print("Processing: " + input + file);
    open(input + file);
    print("Saving to: " + output);
    saveAs("TIFF", output+file);
    close();
}
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1 回答 1

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欢迎（我也是新人）。

我看到两个问题。将文件名模式与file变量匹配，而不是input（此处输入为文件夹名称）。

其次，更重要的是，处理步骤（那些 if/else-if 语句）需要介于以下之间：

open(input + file);

和

saveAs("TIFF", output+file);

这是您的代码的修改版本，可以理解这个想法。

function processFile(input, output, file) {

    print("Processing: " + input + file);
    open(input + file);

    if (indexOf(file, "boats.tif") >= 0) {
        run("Multiply...", "value=0.2");
    }

    print("Saving to: " + output);
    saveAs("TIFF", output + file);
    close();
}
于 2019-08-21T00:46:20.030 回答