我只是将文件输入 plink 时遇到问题（我对编码很陌生）。目前，我只是想在plink中制作一个床文件
我最近运行了一个 HD SNP Array 来寻找拷贝数变异。在我尝试将 ped 和 map 文件输入到 plink 之前，一切似乎都很好。最初，我收到“.ped 文件中缺少一半调用”的错误消息，但是当我检查文件行时，我看不到任何问题，即在错误消息中注明的位置，有一个 0/0。
经过多次尝试解决这个问题，我被建议尝试使用 vcf 格式的文件并将这些文件输入 plink。我现在收到一条不同的错误消息：
.vcf 文件第 533890 行的变体 bp 坐标无效
我在整个互联网上进行了搜索，但无法找到任何解决方案
这是我试图运行的代码行：
/data1/_software/plink/plink --vcf RBV_MNEc670_BPW_NoPQC.vcf --make-bed --out SNP_array_bed --horse --no-pheno --no-sex --no-parents --no-fid
我知道我想制作一个床文件，而且我很确定我没有犯任何语法错误。我当前的错误消息如下：
检测到 257665 MB RAM；为主工作区保留 128832 MB --vcf：533k 变体已完成。错误：.vcf 文件第 533890 行的变体 bp 坐标无效。
任何帮助将不胜感激！