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我一直在遵循成功保存/恢复 GPflow 模型的方法。但现在我遇到了障碍。

当我尝试使用线性均值函数恢复模型时,恢复会因错误而崩溃。

我认为问题在于 tensorflow 线性均值函数对象的命名约定。上面的“-44dbadbb-0”是随机的,每次重建模型时都会发生变化,所以如果我在保存模型时检查张量名称

from tensorflow.python.tools.inspect_checkpoint import print_tensors_in_checkpoint_file
print_tensors_in_checkpoint_file(file_name='./model.ckpt', tensor_name='', all_tensors=False)

我得到回报:

线性-eeb5f9f3-0/A/无约束 (DT_DOUBLE) [1,1] 线性-eeb5f9f3-0/b/无约束 (DT_DOUBLE) [1] 模型/X/dataholder (DT_DOUBLE) [15,1] 模型/Y/dataholder (DT_DOUBLE) [15,1] model/kern/kernels/0/lengthscales/unconstrained (DT_DOUBLE) [] model/kern/kernels/0/variance/unconstrained (DT_DOUBLE) [] model/kern/kernels/1/lengthscales/无约束 (DT_DOUBLE) [] 模型/内核/内核/1/方差/无约束 (DT_DOUBLE) [] 模型/似然/方差/无约束 (DT_DOUBLE) []

线性函数显然与试图恢复的模型具有不同的名称。

我试图通过在恢复之前重命名变量来解决这个问题,但这不适用于 tensorflow。我也尝试了不同的保存/恢复方法,但是我无法从模型中采样。

保存模型


    import gpflow
    import numpy as np
    import random
    import tensorflow as tf

    # define data
    rng = np.random.RandomState(4)
    X = rng.uniform(0, 5.0, 15)[:, np.newaxis]
    Y = np.sin((X[:, 0] - 2.5) ** 2).reshape(len(X),1)

    # define the mean function
    mf = gpflow.mean_functions.Linear(np.ones((1,1)),np.zeros((1,)))

    # create the GP model
    with gpflow.defer_build():
        k = gpflow.kernels.Matern32(1)+gpflow.kernels.RBF(1)
        m = gpflow.models.GPR(X, Y, kern=k,name='model',mean_function=mf)
        m.likelihood.variance = 1e-03
        m.likelihood.trainable = False

    tf.global_variables_initializer()

    tf_session = m.enquire_session()
    m.compile( tf_session )

    gpflow.train.ScipyOptimizer().minimize(m)

    saver = tf.train.Saver()
    save_path = saver.save(tf_session, "./model.ckpt")
    print("Model saved in path: %s" % save_path)

恢复模型


    import gpflow
    import numpy as np
    import random
    import tensorflow as tf

    # define data
    rng = np.random.RandomState(4)
    X = rng.uniform(0, 5.0, 15)[:, np.newaxis]
    Y = np.sin((X[:, 0] - 2.5) ** 2).reshape(len(X),1)

    # define the mean function
    mf = gpflow.mean_functions.Linear(np.ones((1,1)),np.zeros((1,)))

    with gpflow.defer_build():
        k = gpflow.kernels.Matern32(1)+gpflow.kernels.RBF(1)
        m = gpflow.models.GPR(X, Y, kern=k,name='model',mean_function=mf)
        m.likelihood.variance = 1e-03
        m.likelihood.trainable = False

    # construct and compile the tensorflow session
    tf.global_variables_initializer()
    tf_session = m.enquire_session()
    m.compile( tf_session )

    saver = tf.train.Saver()

    save_path = saver.restore(tf_session, "./model.ckpt")
    print("Model loaded from path: %s" % save_path)

    m.anchor(tf_session)

save_path = saver.restore(tf_session, "./model.ckpt")代码因错误而崩溃:

NotFoundError(请参阅上面的回溯):在检查点中找不到 Key Linear-44dbadbb-0/A/unconstrained...

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1 回答 1

1

做了很多事情——但是一次性构建整个模型(即张量流图)的defer_build()一部分是所有张量流变量和占位符都有一致的名称,它们的所有名称都与模型本身的名称有关(你通过将name='model'关键字参数传递给模型构造函数来设置)。

但是,在您的代码中,Linear均值函数是在范围之外defer_build()构造的。这意味着 gpflow 必须立即为它构建一个图形 - 包括为参数设置变量(在这种情况下是斜率和偏移量)。所有 tensorflow 变量都存在于全局名称空间中,因此允许创建多个对象的唯一方法是为它们分配随机名称。(例如,想象一下想要构造两个相同类型的内核的总和!)

幸运的是,修复很简单:只需将 mean 函数的构造移动到defer_build块中:

with gpflow.defer_build():
    # define the mean function
    mf = gpflow.mean_functions.Linear(np.ones((1,1)), np.zeros((1,)))

    k = gpflow.kernels.Matern32(1) + gpflow.kernels.RBF(1)
    m = gpflow.models.GPR(X, Y, kern=k, mean_function=mf, name='model')
    m.likelihood.variance = 1e-03
    m.likelihood.trainable = False

# construct and compile the tensorflow session
tf.global_variables_initializer()
tf_session = m.enquire_session()
m.compile(tf_session)

如果您在“保存”和“加载”脚本中都执行此操作,那么一切都会按照您的预期运行并且希望如此。希望这可以帮助!

于 2019-07-11T14:53:54.477 回答